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测序深度的分布图是很常见的一类图,可用于发现染色体片段或整条染色体的缺失或是重复。如果是缺失,测序时捕获的概率就小,最终比对呈现出来的就是有一段区域深度明显偏低;如果是重...
前言 本月将更新八篇Python有趣系列文章。本系列通过多个有趣案例,讲解Python的玩法,其中包含如下内容,一一推进讲解。 爬虫 数据分析 机器学习 项目背景 最近知乎老...
RNA-seq分析简洁版[//www.greatytc.com/p/72c871663e62],用重新下载的肝癌数据[https://www.ncbi.nlm.ni...
STAR+RSEM+Deseq2视频课程链接已经公开, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www...
logistic回归是一种广义的线性回归,通过构造回归函数,利用机器学习来实现分类或者预测。 原理 上一文简单介绍了线性回归,与逻辑回归的原理是类似的。 预测函数(h)。该函...
数据我们将建立一个逻辑回归模型来预测一个学生是否被大学录取。假设你是一个大学系的管理员,你想根据两次考试的结果来决定每个申请人的录取机会。你有以前的申请人的历史数据,你可以用...
今年Pfam数据库发文称:过去几年,Pfam数据库发生了重大变化! 细看了一下,果真变化重大! 吓得我赶紧过来把笔记更新了~~ * 32.0版的Pfam更新了些什么 ?(31...
宏基因组分析教程microPITA | 宏基因组测序前,你可以这样筛选样本 microPITA 加拿大安大略研究所建立的生物信息网 1. 什么是 组装? 基因组测序时将测得的...
2018.9.7 星期四 多云 biolearn cd-hit 是用于蛋白质序列或核酸序列聚类的工具,根据序列的相似度对序列进行聚类以去除冗余的序列,一般用于构建非冗余...
FastQC是一款基于Java的软件,一般都是在linux环境下使用命令行运行,它可以快速多线程地对测序数据进行质量评估(Quality Control),其官网地址为:Ba...
文中会对遇到的问题进行解答,图表部分也做了比较详细的说明,对初学者比较友好,当然知道实验部分会让你对数据如何得来的有一个整体的把握,知其然而知其所以然,分析和解释数据起来会更...
loc中的数据是列名,是字符串,所以前后都要取;iloc中数据是int整型,所以是Python默认的前闭后开 一、loc函数 构建数据集df loc函数主要通过行标签索引行数...
欢迎关注公众号:oddxix 主成分分析简介 主成分分析 (PCA, principal component analysis)是一种数学降维方法, 利用正交变换(ortho...