前言 docker镜像极大方便了软件的使用,但docker对于集群用户却不友好,所有命令都需要root权限。近期在集群使用singularity,终于把长期以来的痛点解决了。...
这个你需要跟你老师交流,我也不知道你分析的目的是啥😰是分析单个基因还是整体的
全长转录组分析-小麦前言 近期分析了一部分小麦的全长转录组数据,参考了网上许多流程,收获良多,在此记录一下 全长转录组测序基于PacBio单分子实时测序技术(SMRT cell),凭借超长读长的...
@橘子皮C 我没有用过呢,看起来是没有问题的
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@橘子皮C 我没有用过这个软件呢,,
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@fde908246b02 cDNA_Cupcake,安装这个软件
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GitHub - Runsheng/primervcf: primderdiffer submodule: primervcf[https://github.com/Runs...
@虹影_0bcb 不需要,这一步很耗资源
小麦RNA-seq利用hisat2构建index过程根据简书崔女神文章//www.greatytc.com/p/071c1757ded1利用hisat2来构建小麦的转录组的索引文件,服务器内存64G,构建的命令如下:...
@d7e4fb9f6a05 额,就是内存不够啊,你是用自己电脑跑的吧?
单拷贝直系同源基因构建物种进化树最近用Orthofinder做物种进化树,最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大,在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的,然后跟老师...
@d7e4fb9f6a05 改个名,paste在一起太长了,手动操作也可以
单拷贝直系同源基因构建物种进化树最近用Orthofinder做物种进化树,最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大,在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的,然后跟老师...
@dubladaba emmmm见仁见智吧
单拷贝直系同源基因构建物种进化树最近用Orthofinder做物种进化树,最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大,在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的,然后跟老师...
@今天能毕业了吗 可以
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由于分析需求需要使用PhastCons分析DNA的保守序列,以及使用SIFT软件分析氨基酸变异的有害性,经过一段时间的探索,对这两款软件已经有了还算全面的认识,在此记录一下分...
@生信摆烂人 一般基因组注释错误率很高,用这些位点信息并不靠谱,你测个三代在IGV上对比一下基因组注释就知道了。而人类基因组研究的多,注释啥的都很准确,加上这些信息是有必要的
小麦RNA-seq利用hisat2构建index过程根据简书崔女神文章//www.greatytc.com/p/071c1757ded1利用hisat2来构建小麦的转录组的索引文件,服务器内存64G,构建的命令如下:...
@生信摆烂人 spades组装转录本之后,用minimap2比到基因组上就行了,与其这么费劲还不如直接测个全长,结果也更准确
小麦RNA-seq利用hisat2构建index过程根据简书崔女神文章//www.greatytc.com/p/071c1757ded1利用hisat2来构建小麦的转录组的索引文件,服务器内存64G,构建的命令如下:...