都2023了，你还在做传统的ceRNA?老板指定的研究方向就是miRNA，然而传统的miRNA调控模式就烂大街了，成为批量生产SCI的超级“灌水”工具，基本没有创新性可言，遇...
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都2023了，你还在做传统的ceRNA?老板指定的研究方向就是miRNA，然而传统的miRNA调控模式就烂大街了，成为批量生产SCI的超级“灌水”工具，基本没有创新性可言，遇...
做代谢组研究，你一定会用到它——HMDB 人类代谢组数据库(HMDB)于2007年首次发布，被认为是人类代谢研究的标准代谢组学资源，包含有关人类代谢物及其生物学作用、生理浓度...
1.构建DESeq2对象 （1）从SummarizedExperiment对象构建DESeqDataSet对象 se为RangedSummarizedExperiment对象...
由于实验人员、技术、环境、时间点、芯片处理等各种因素原因，得到的芯片表达矩阵是含有非生物学因素差异的。有时候想分析两组间差异，但是一个数据集下面的样本数量略少，因此想整合多个...
今天又是入门单细胞分析的一天在单细胞分析当中，我们会用到两个函数：NormalizeData()和ScaleData()，这两个函数的区别到底在哪儿？它们到底对我们的单细胞数...
SingleCellExperiment是通过SingleCellExperiment包创建的单细胞数据分析对象，已有几十个单细胞R包支持。其衍生自SummarizedExp...
在实践之前，我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点：（参考文章：//www.greatytc.com/p/8aca72809c5c） 组蛋白修饰能预测染色质的类型（异...
What is HOMER？ HOMER is a software for motif discovery and ChIP-Seq analysis HOMER软件是Li...
以ChIPseq为例我们想要看某一个转录因子在所有TSS附近的信号的平均，看在一个TSS附近直接用igv打开就行，但当我们看所有TSS或者给定一个bed文件的时候，就需要借用...
