要分享就用点心,一大批代码都是错误的,你看代码前后连接的起来吗
RNA-seq入门实战(四):差异分析前的准备——数据检查本节概览:数据预处理, 进行样本间具有可比性boxplot查看样本的基因整体表达情况查看不同分组的聚类情况:样本hclust 图、距离热图、PCA图、差异基因热图、相关性热图...
要分享就用点心,一大批代码都是错误的,你看代码前后连接的起来吗
RNA-seq入门实战(四):差异分析前的准备——数据检查本节概览:数据预处理, 进行样本间具有可比性boxplot查看样本的基因整体表达情况查看不同分组的聚类情况:样本hclust 图、距离热图、PCA图、差异基因热图、相关性热图...
都2023了,你还在做传统的ceRNA?老板指定的研究方向就是miRNA,然而传统的miRNA调控模式就烂大街了,成为批量生产SCI的超级“灌水”工具,基本没有创新性可言,遇...
做代谢组研究,你一定会用到它——HMDB 人类代谢组数据库(HMDB)于2007年首次发布,被认为是人类代谢研究的标准代谢组学资源,包含有关人类代谢物及其生物学作用、生理浓度...
1.构建DESeq2对象 (1)从SummarizedExperiment对象构建DESeqDataSet对象 se为RangedSummarizedExperiment对象...
由于实验人员、技术、环境、时间点、芯片处理等各种因素原因,得到的芯片表达矩阵是含有非生物学因素差异的。有时候想分析两组间差异,但是一个数据集下面的样本数量略少,因此想整合多个...
大佬请问一下为什么expm之后,normalization 还persists
seurat-FindAllMarkers()源码解析现在回想单细胞项目的一些常规分析,clusters/groups间的差异表达分析(differential expression analysis)几乎是分析必备项,Find...
今天又是入门单细胞分析的一天在单细胞分析当中,我们会用到两个函数:NormalizeData()和ScaleData(),这两个函数的区别到底在哪儿?它们到底对我们的单细胞数...
SingleCellExperiment是通过SingleCellExperiment包创建的单细胞数据分析对象,已有几十个单细胞R包支持。其衍生自SummarizedExp...
我想问个问题,rlog之后的数据可以直接拿来做limma分析吗,因为limma要求输入的是经过log2转化的,
DESeq2详细用法1.构建DESeq2对象 (1)从SummarizedExperiment对象构建DESeqDataSet对象 se为RangedSummarizedExperiment对象...
在实践之前,我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点:(参考文章://www.greatytc.com/p/8aca72809c5c) 组蛋白修饰能预测染色质的类型(异...
楼主请教一个问题,这里fastqc质控后没进行去接头是否影响鉴定SE,
What is HOMER? HOMER is a software for motif discovery and ChIP-Seq analysis HOMER软件是Li...