在单细胞转录组解析肥厚性心肌病发病机制[//www.greatytc.com/p/f270b9431427]里面看到计算某基因与其它基因的相关性 方法里写的是这样做...
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简介 plot1cell包提供了多种单细胞数据可视化的高级功能,可以基于Seurat分析结果对象直接进行可视化绘图,主要依赖于Seurat V4,circlize,Compl...
1. 使用注释 VCF 文件 1.1 下载和安装 SnpEff 1.2 下载参考基因组数据库 手动下载(选择符合自己需要的物种及版本):https://sourceforge...
软件说明 Ensembl VEP是一款突变注释文件,但是相关的配置比较困难。这次我们使用conda进行安装,可以跳过繁琐的环境配置过程。http://asia.ensembl...
文章来源:R中的apply(),lapply(),sapply(),tapply()函数以及示例 本教程旨在介绍apply()函数集合。apply()函数是所有集合中最基本的...
1 简介 BCFtools 是一款多种实用工具的集合,它可以用于处理VCF文件和二进制的BCF文件。它可以接受VCF格式、压缩的VCF格式以及BCF格式,并能自动检测输入的格...
题外音:speedseq是一套流程,套用了大量三方软件,但是居然也能发到Nature Methods上!惊讶之余查看了一下代码,非常佩服,简直是教科书一样的模式,太赞了! 1...
TITLE: 全外显子测序数据分析AUTHOR: Shuntai Yu [TOC] 外显子是形成mRNA后剪接剩下的部分,包括UTR区与CDS,而CDS则是真正编码蛋白的...
熟悉R的朋友都会知道,dplyr包是对原始的数据集进行清洗、整理以及变换的有力武器之一。但是其使用会局限于你需要有打开R/R studio或者通过R脚本来执行dplyr。对于...