目的 基因功能的注释依赖于基因结构或者序列,将基因序列或蛋白序列和主流数据库进行比对获取该基因的功能信息,最终对预测的编码基因进行功能注释,从而了解相关生物学意义。 做法 E...
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目的 基因功能的注释依赖于基因结构或者序列,将基因序列或蛋白序列和主流数据库进行比对获取该基因的功能信息,最终对预测的编码基因进行功能注释,从而了解相关生物学意义。 做法 E...
一、什么是Jupyter Notebook? 1. 简介 Jupyter Notebook是基于网页的用于交互计算的应用程序。其可被应用于全过程计算:开发、文档编写、运行代码...
如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候,大家得到的序列都是单个基因的长度,所以一般都是逐个基因的比较,用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方...
cds文件:注释信息里的蛋白编码序列pep文件:cds对应序列翻译成的氨基酸序列从NCBI上下载基因组时,有的并没有上传cds文件和pep文件,此时该怎么办呢? (1)利用脚...
做科研的都知道开创性的工作自然意义重大,但那是可遇不可求。迅速跟进大牛们开创性的思路或者方法,结合自身的研究基础,做出类似的成果无疑是个高效的策略。 早些年的转录组可谓是典型...
在实验室中,我们经常需要对分子生物学数据进行分析,常见的有DNA和蛋白质分子序列比对。分子序列比对分为全局序列比对和局部序列比对两种情况。其具体算法我们将在以后的文章中详细介...
欢迎关注:oddxix 有问题,欢迎后台沟通 概念 广义:转录组(transcriptome)是特定细胞在某一功能状态下转录本的总和。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其...