一、环境 1、使用系统:win102、虚拟机:VMware WorkstationPro 153、macos 10.13 (mac系统镜像文件)4、Unlocker 3.0 ...
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有时候我们想看某一特定通路的富集情况,这时就需要获取该通路的基因集。 一、从 GO 中获取 下载脚本 getGoTerm.R[https://github.com/Jiaha...
当我们在图形中添加标签时,标签之间很容易相互重叠,包ggrepel就专门用来解决这个问题! 首先我们来看看通过geom_text()添加标签时的情形: 可以看到可视化效果不是...
ggplot2对图例的设置主要为guides()功能下的guide_colorbar()和guide_legend()两个函数: guide_colorbar()函数内部函数...
用david转换成ENTREZID基因 对KEGG富集结果可视化 画出来选定某一通路的图形 画出来选定某一通路的图形,我们的基因集中在该通路出现的基因变成绿色显示在该通路中
导读 pheatmap默认会对输入矩阵数据的行和列同时进行聚类,但是也可以通过布尔型参数cluster_rows和cluster_cols设置是否对行或列进行聚类,具体看分析...
hello,大家好,最近看文献写方法都有点累了,今天就轻松一下,写一个简单的内容分享给大家,那就是ggplot2在绘图的时候一键修改字体。 R语言绘图中,尤其是使用ggplo...
韦恩(Venn)图是常见统计图之一,用于展示各样本(或分组)之间共有(或特有)元素的数量(或比例)。 例如做RNA-seq的最直接目的,大多是鉴定差异表达的基因。当试验涉及到...
Beyond Read-Counts: Ribo-seq Data Analysis to Understand the Functions of the Transcrip...