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一、环境 1、使用系统：win102、虚拟机：VMware WorkstationPro 153、macos 10.13 （mac系统镜像文件）4、Unlocker 3.0 ...
有多个GO ID时能否批量查询呢？
R语言获取 GO/KEGG 中某一通路的基因集有时候我们想看某一特定通路的富集情况，这时就需要获取该通路的基因集。 一、从 GO 中获取 下载脚本 getGoTerm.R[https://github.com/Jiaha...
有时候我们想看某一特定通路的富集情况，这时就需要获取该通路的基因集。 一、从 GO 中获取 下载脚本 getGoTerm.R[https://github.com/Jiaha...
当我们在图形中添加标签时，标签之间很容易相互重叠，包ggrepel就专门用来解决这个问题！ 首先我们来看看通过geom_text()添加标签时的情形： 可以看到可视化效果不是...
ggplot2对图例的设置主要为guides()功能下的guide_colorbar()和guide_legend()两个函数： guide_colorbar()函数内部函数...
用david转换成ENTREZID基因 对KEGG富集结果可视化 画出来选定某一通路的图形 画出来选定某一通路的图形，我们的基因集中在该通路出现的基因变成绿色显示在该通路中
导读 pheatmap默认会对输入矩阵数据的行和列同时进行聚类，但是也可以通过布尔型参数cluster_rows和cluster_cols设置是否对行或列进行聚类，具体看分析...
hello，大家好，最近看文献写方法都有点累了，今天就轻松一下，写一个简单的内容分享给大家，那就是ggplot2在绘图的时候一键修改字体。 R语言绘图中，尤其是使用ggplo...
韦恩（Venn）图是常见统计图之一，用于展示各样本（或分组）之间共有（或特有）元素的数量（或比例）。 例如做RNA-seq的最直接目的，大多是鉴定差异表达的基因。当试验涉及到...
Beyond Read-Counts: Ribo-seq Data Analysis to Understand the Functions of the Transcrip...
前言:微博参与话题 #给你四年时间你也学不会生信# Add Legends to Plots | 图例 Arguments | 参数 x, y:用于定位图例，也可用单键词"b...
前言 饼图，是将总体看作一个圆，按照各分类的占比情况将圆划分大小不同的扇形，以弧度的大小来表示某一分类的占比。 饼图可以让人快速的了解各分类的情况，但一般分类的数量不能太多，...
一、对应关系 NCBI的版本包括GRCh36,37,38，UCSC包括hg18,19,38, ENSEMBL有各种release，他们之间的对应关系如下：GRCh36 (hg...
亚细胞定位是指某种蛋白或某个基因表达产物在细胞内的具体存在部位，包括细胞核、细胞质和细胞膜等部位。传统的实验方法有，利用一些荧光蛋白如GFP、YFP，通过其在激光照射下发出的...
这样读取gtf文件回比直接使用read.table()好，因为生成的dataframe能够比较清楚地分开，并且有title。 除了import函数，rtracklayer包中...