作者：ahworld链接：scanpy读取10X HD经验[https://mp.weixin.qq.com/s/oLijUwLC19aVuEugHV1bow]来源：微信公众...
发简信
IP属地：黑龙江
作者：ahworld链接：scanpy读取10X HD经验[https://mp.weixin.qq.com/s/oLijUwLC19aVuEugHV1bow]来源：微信公众...
作者：ahworld链接：GO 富集结果可视化优化笔记[https://mp.weixin.qq.com/s/VsAHJhuhbUBe1EJUA8Vy9Q]来源：微信公众号s...
安装Anaconda down load anaconda wget <https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2024.02...
作者：ahworld链接：jupyter调用多个R，python kernel[https://mp.weixin.qq.com/s/O_YGNsIWylVKuQTuL18x...
作者：ahworld链接：空转分析代码备忘录：seurat可视化代码雕琢[https://mp.weixin.qq.com/s/nzKN6-AYiZZflbPHreRZMQ]...
作者：snail编辑：angelica 引言 跟着阿拉丁一起学习的时间又到了～～ ATAC-seq利用DNA转座酶（Tn5）切割开放的DNA区域并结合二代高通量测序技术来研究...
可以尝试在excel中规整数据，然后复制粘贴到 sublime tex3保存
内参基因筛选在线版GeNorm和NormFinder工具发布作者：ahworld链接：内参基因筛选在线版GeNorm和NormFinder工具发布[https://mp.weixin.qq.com/s/K_fsE-7hKlwBM4FJ...
可以看看 calculate_branch_feature_importance，在文中有写
单细胞轨迹推断分析（拟时间分析）dyno使用教程作者：yuanzan链接：dyno使用教程--1个R包实现59种单细胞轨迹推断分析)来源：微信公众号著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者。 在上一期的《单细胞轨迹分析...
看不到你的数据，所以没有办法作出建议，
你可以尝试看看 adata.obs['cell_type'].unique() 都包含哪些内容
seurat结果转为scanpy可处理对象作者：ahworld链接：seurat结果转为scanpy可处理对象来源：微信公众号seqyuan著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者。 怎样把seurat的对象转换...
跳过guidelines那一步就行，
直接给methods_selected赋值就可以
单细胞轨迹推断分析（拟时间分析）dyno使用教程作者：yuanzan链接：dyno使用教程--1个R包实现59种单细胞轨迹推断分析)来源：微信公众号著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者。 在上一期的《单细胞轨迹分析...
T细胞和B细胞被激活之后，都会单克隆增殖，但这不是基因重排；基因重排在中枢发育阶段已经完成。B细胞在分化为浆细胞之前会发生体细胞高频突变，以合成高度特异性的抗体；但这不是基因重排，而是基因的点突变
作者：ahworld链接：seurat结果转为scanpy可处理对象[https://mp.weixin.qq.com/s/fwdjnekdgWCOZ_yer6Q-yQ]来源...
@Cooperstation
sc.pp.neighbors(adata, n_neighbors=10, n_pcs=40)
sc.tl.diffmap(adata)
sc.pp.neighbors(adata, n_neighbors=10, use_rep='X_diffmap')
seurat结果转为scanpy可处理对象作者：ahworld链接：seurat结果转为scanpy可处理对象来源：微信公众号seqyuan著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者。 怎样把seurat的对象转换...
@Cooperstation
运行sc.pp.neighbors(adata, n_neighbors=10, use_rep='X_diffmap')之前，运行sc.tl.diffmap(adata)了吗
seurat结果转为scanpy可处理对象作者：ahworld链接：seurat结果转为scanpy可处理对象来源：微信公众号seqyuan著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者。 怎样把seurat的对象转换...
@Cooperstation
library(Seurat)
library(SeuratData)
library(SeuratDisk)
DefaultAssay(rds) <- "RNA"
SaveH5Seurat(rds, filename = "obj.h5Seurat")
Convert("obj.h5Seurat", dest = “h5ad")
seurat结果转为scanpy可处理对象作者：ahworld链接：seurat结果转为scanpy可处理对象来源：微信公众号seqyuan著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者。 怎样把seurat的对象转换...
@Cooperstation 可以转换成h5ad
seurat结果转为scanpy可处理对象作者：ahworld链接：seurat结果转为scanpy可处理对象来源：微信公众号seqyuan著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者。 怎样把seurat的对象转换...
简介 OMIM 全称叫做Online Mendelian Inheritance in Man， 是一个不断更新的人类孟德尔遗传病的数据库，这个数据库主要关注人类基因变异和表...
作者：ahworld链接：GPU版scanpy (rapids)实践 | 大型单细胞数据分析利器[https://mp.weixin.qq.com/s/H4IfeI6TdK7...
作者：ahworld链接：内参基因筛选在线版GeNorm和NormFinder工具发布[https://mp.weixin.qq.com/s/K_fsE-7hKlwBM4FJ...
我没有这个的
细胞通讯-iTALK使用方法作者：ahworld链接：细胞通讯-iTALK使用方法来源：微信公众号-seqyuan著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者。 什么是细胞通讯？ 多细胞生物由不同类型的...