搬砖养猪者

lr2rmats lr2rmats 基于Snakemake[https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/]进行分析，可利用三代和二代...

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前言 之前我们介绍了maSigpro的基本建模方式：分析时间序列的RNA-seq tool[//www.greatytc.com/p/ad76dcfdf840]，这...

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导读 ggtree由R语言大神Y叔纸笔，于2018年发表在Molecular Biology and Evolution杂志上，现引用已达407（2019.10.10 goo...

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1. find_circ鉴定circRNA的原理 find_circ 的基本原理: find_circ根据Bowtie2比对结果，从没有比对到参考序列的 reads 的两端各...

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环状RNA的识别包含了序列比对和环状RNA预测两步，该软件目前更新到了v2版本，相比v1版本，用法有较大变化。在v1版本中只支持tophat-fusion和STAR两款软件进...

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在RNA-seq中针对circRNA的鉴定与定量的综合性分析方法——CIRIquant CIRIquant 与其他同类算法相比，其在鉴定circRNA的过程中降低了假阳性率。...

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在最初的环状RNA研究中，认为环状RNA都是由exon通过反向剪切构成的,称之为exonic circRNA，只有这样的环状RNA能够由PCR反应验证出来的。 CIRI是一款...

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独特的环状结构让二代测序较短的读长限制了对其鉴定以及定量，目前仅仅依靠其反向剪切序列；另外，环状RNA的表达总是与来源基因（host gene）线性RNA的表达纠缠不清，让我...

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在clusterProfiler进行富集分析时，发现目前只支持19个物种，如果要对这些物种之外的物种进行富集分析则需要自己构建orgDb物种包。 1.首先安装eggnog-m...

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资料来源应该是最好的eggnog-mapper功能注释教程[//www.greatytc.com/p/e646c0fa6443] 1. eggnog-mapper介...

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circRNA可以作为sponge吸附大量的miRNA，从而调控下游基因的表达。对circRNA-miRNA结合的可视化我们可以通过 circlize[https://jok...

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facet_grid()形成由行和列面化变量定义的面板矩阵。当有两个离散变量，并且这些变量的所有组合存在于数据中时，它是最有用的。如果只有一个具有多个级别的变量，请尝试fac...