庄小尽

读取和汇总gistic输出文件 maftools : Summarize, Analyze and Visualize MAF Files[https://rdrr.io/b...

oceanandshore

注释是很关键的一步，这几天先把注释完全搞懂。现在有几个问题需要解决： 1、搞清楚不同注释方法（手动、网站、用已发表的文章里面的去注释同一测序样品）；2、如何提取细胞亚群，进行...

芒果小M

在生信分析或者一些其他的数据分析中，经常会需要绘制桑基图，在这里推荐一个非常nice的R包-sankeyD3（类似于networkD3，但是比其功能更加完善），其出的桑基图比...

单细胞空间交响乐

hello，大家好，今天给大家分享一个新的空间转录组技术---Digital Spatial Profiler（DSP），目前公司打算引进，我们来看看这个空间技术又有什么样独...

纪伟讲测序

韦恩（Venn）图是常见统计图之一，用于展示各样本（或分组）之间共有（或特有）元素的数量（或比例）。 例如做RNA-seq的最直接目的，大多是鉴定差异表达的基因。当试验涉及到...

单细胞空间交响乐

作者，追风少年i~ 8月了，马上七夕节就要到了，在我们民间一直流传着牛郎织女七夕鹊桥相会的神话传说，从我记事开始，每次七夕仰望星空，也就见过一次银河，希望这一次，也有这个福气...

单细胞空间交响乐

最近父亲住院，需要人照顾，需要资金，所以不要脸的求一发大家的支持。 目前单细胞分析而言，分析方向大致包括以下几个方面，1）器官发育（这个用空间转录组更为合适）；2）疾病样本，...

单细胞空间交响乐

作者，追风少年i 周一了，躺平了半年，说实话，躺平感觉是真的不错，😄，不过大家不要学我，人人都躺平，那就真的没啥希望了。 今天继续分享关于10X空间转录组的分析内容，我们来深...

小熊_wh

2022年4月份TCGA进行了更新，测序数据变成了STAR-count文件。以往count文件是htseq.counts.gz格式，现在变成star_gene_counts....