读取和汇总gistic输出文件 maftools : Summarize, Analyze and Visualize MAF Files[https://rdrr.io/b...
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注释是很关键的一步,这几天先把注释完全搞懂。现在有几个问题需要解决: 1、搞清楚不同注释方法(手动、网站、用已发表的文章里面的去注释同一测序样品);2、如何提取细胞亚群,进行...
在生信分析或者一些其他的数据分析中,经常会需要绘制桑基图,在这里推荐一个非常nice的R包-sankeyD3(类似于networkD3,但是比其功能更加完善),其出的桑基图比...
hello,大家好,今天给大家分享一个新的空间转录组技术---Digital Spatial Profiler(DSP),目前公司打算引进,我们来看看这个空间技术又有什么样独...
在导出数据时报错: 查看数据结构发现有list的成分所以将其unlist后重新合并 或者 问题解决
韦恩(Venn)图是常见统计图之一,用于展示各样本(或分组)之间共有(或特有)元素的数量(或比例)。 例如做RNA-seq的最直接目的,大多是鉴定差异表达的基因。当试验涉及到...
利用靶向测序,可将一组基因或基因组区域分离出来并对其进行测序。使用二代测序(NGS)的靶向方法让研究人员能够将时间、费用和数据分析集中在感兴趣的特定区域。这种靶向分析包括外显...
对肿瘤免疫分型的研究有很多,通过对肿瘤组织进行免疫组化染色较受研究者广泛认可的就是肿瘤的三大免疫分型:“免疫浸润型”:CD8+ T细胞可以浸润到肿瘤内部“免疫排斥型”:虽然也...
作者,追风少年i~ 8月了,马上七夕节就要到了,在我们民间一直流传着牛郎织女七夕鹊桥相会的神话传说,从我记事开始,每次七夕仰望星空,也就见过一次银河,希望这一次,也有这个福气...
最近父亲住院,需要人照顾,需要资金,所以不要脸的求一发大家的支持。 目前单细胞分析而言,分析方向大致包括以下几个方面,1)器官发育(这个用空间转录组更为合适);2)疾病样本,...
作者,追风少年i 周一了,躺平了半年,说实话,躺平感觉是真的不错,😄,不过大家不要学我,人人都躺平,那就真的没啥希望了。 今天继续分享关于10X空间转录组的分析内容,我们来深...
了解前提 微卫星:整个基因组有超过 100000 个被叫作「微卫星」的短串联重复序列区域,复制过程中易于滑动出现错误,因此非常依赖于 MMR 系统修复。 错配修复MMR(mi...
骨髓来源抑制细胞(MDSCs)是病理激活的中性粒细胞和单核细胞,具有较强的免疫抑制活性。它们与许多病理条件下的免疫反应调节有关,与癌症的不良临床结果密切相关。 1. 主要表型...
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