DNA通过转录,控制着mRNA的合成,而mRNA是蛋白质合成的模板,它决定了蛋白质的序列结构、功能等信息。把mRNA看作一种语言,它由4种不同碱基的核苷酸组成(A、U、C、G...
DNA通过转录,控制着mRNA的合成,而mRNA是蛋白质合成的模板,它决定了蛋白质的序列结构、功能等信息。把mRNA看作一种语言,它由4种不同碱基的核苷酸组成(A、U、C、G...
图中标示了箱线图中每条线和点表示的含义,其中应用到了分位数的概念线的主要包含五个数据节点,将一组数据从大到小排列,分别计算出他的上边缘(Maximum),上四分位数(Q3),...
生物信息学的日常就是利用五花八门的工具和各种各样的数据打交道,很多时候需要在命令行安装软件或者包。我相信每一个生信人都碰到过安装软件或包时无法解决依赖的囧况,安装软件或者包,...
配色,简单来说就是将颜色摆在适当的位置,做一个最好的安排,达到一种和谐的融为一起的一个大效果。 在我们做图表或者做PPT的过程中,好的配色可以让人心情愉悦,也可以帮助我们更好...
很多人推荐《R语言实战》这本书来入门R,当然,这本书非常不错,我也是通过这本书开始接触的R。这种入门的学习路径属于base R first,学习的流程基本是先了解变量的类型、...
以linux系统为例 首先,在$HOME目录下,新建一个文件.Rprofile,并进入vi编辑器: 按下键盘Insert键进入vi的编辑模式,然后我们就可以输入代码配置默认环...
我们都知道生物信息学(Bioinfomatics)包含两个部分:bio和informatics,即利用生物数据通过计算机学或统计学或数学的方法发现这些数据背后所具有的生物学意...
第一步安装: 这里稍微给大家介绍一下RColorBrewer包: RColorBrewer is an R package that allows users to crea...
因为近期要写嵌套for循环,由于运算量有点大,耗时比较久。所以就在谷歌上搜了搜有没有办法可以提升python for loop的速度,然后就发现了非常好用的模块:Numba ...
生物信息学的分析很大一部分都是围绕序列展开,可以说序列分析催生了生物信息学。比如通过与参考基因组序列进行比对,检测各种变异;RNA-seq数据与参考基因组比对,进行定量。 给...
高通量的原始数据通常情况下会上传到NCBI的SRA(Sequence Read Archive)数据库。当我们需要用到这些数据的时候,就需要合适的方法来下载。常见的下载方法:...
构建物种的系统发育树,计算kaks值或者比较基因组学和进化的其他分析都少不了需要寻找同源基因。之前已经介绍过Orthomcl的自动化使用,Orthomcl也是目前引用最好的寻...
亚细胞定位是指某种蛋白或某个基因表达产物在细胞内的具体存在部位,包括细胞核、细胞质和细胞膜等部位。传统的实验方法有,利用一些荧光蛋白如GFP、YFP,通过其在激光照射下发出的...
什么是Ka/Ks The ratio of the number of nonsynonymous substitutions per nonsynonymous site ...
相信连过远程服务器的小伙伴对ssh命令一定不陌生,经常会用ssh命令从一个服务器登录到另一个服务器( $ ssh username@xx.xx.xx.xx )。当我们需要两个...
是的,按Ctrl + B可以往前翻,已更新,谢谢提醒~
一天一点命令行之 lessLinux命令行界面通常会使用cat、less和more三个命令来查看文件内容。 其中,cat命令是直接输出文件的全部内容,如果文件内容很多行,那么就会占满屏幕,很不方便查看...
Linux命令行界面通常会使用cat、less和more三个命令来查看文件内容。 其中,cat命令是直接输出文件的全部内容,如果文件内容很多行,那么就会占满屏幕,很不方便查看...