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简单可行的SeruatV4和v5共存的安装方案_seurat v4安装-CSDN博客[https://blog.csdn.net/qq_52813185/article/de...

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昨天搞了一天，奋战到10点多。终于搞定cellphonedb的安装，说说我的心得。 先说说安装步骤，看似很简单，其实很心酸 conda create -n cpdb pyth...

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一）创建一个新的R环境 conda create -n R4.2 # 创建名为R3.5的环境 source activate R4.2 #激活环 conda install ...

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函数strsplit用于按照指定的字符把长的字符串分割成短的子字符串， strsplit(x, split, fixed = FALSE) 参数split是用于分割字符串， ...

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1）apply apply函数 将数据框或矩阵作为输入， 用于遍历数组中的行或列 apply(x, MARGIN, FUN, ...) ####MARGIN按行计算或按列...

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常见问题： 1）Seurat CCA整合分析后什么情况下用RNAassay，什么时候用intergratedassay？ conserved cell type marker...

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CCA[http://www.idata8.com/rpackage/Seurat/FindIntegrationAnchors.html] 大样本整合推荐rpca[http...

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搞定TCGA批次效应！?[https://www.sci666.com.cn/41622.html] 高通量数据中批次效应的鉴定和处理 - 系列总结和更新[https://b...

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肿瘤的形成通常伴随着瘤床的形成及周围结缔组织和基质的深度改变，最终形成适合肿瘤细胞生存的微环境(TME)；过往研究表明肿瘤微环境中基质的关键组份有利于肿瘤细胞的生长与转移，近...

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单细胞和常规联合分析（胃癌晚期）[https://mp.weixin.qq.com/s/0lJxdpPIhm7OBgzhe48h7A] Bioconductor[http:/...