2016年夏，我进入到Genentech公司进行实习，这是一家在南旧金山的世界上最大的生物制药公司。公司在2009年被罗氏收购，目前是罗氏在北美...

2019年第一天，我载着大宝和豆包以及剩余家当从洛杉矶搬到湾区。我们住的房子，由于客厅住着房东，常年是不开灯的，我们需要摸黑走过狭长的走道，到达...

昨天发现了神器multiqc来整合分析一个目录下所有文件的quality control结果，今天来试着装了一下。 然后又发现了conda这个使...

之前一直用的是Tophat + Htseq-count + Deseq2的分析组合来做rnaseq的回帖，确定基因表达量，以及做差异基因的分析。...

有时候会有这样的分析需求，拿到两个基因，或者两个基因list，虽然它们是不同的基因的，但是可以提一个问题，它们之间的功能注释上有没有相似性呢？ ...

Gene ontology enrichment analysis可能是现在生物信息学里面最常用的分析。以前我一般都是用DAVID这个在线工具来...

org.Hs.eg.db This is a package for genome-wide annotation for human, hav...

做生物信息算下来七八年了，中间会遇到许多的问题以及学习后的解决方案，许多都没有记录下来，这是一个非常遗憾的事情。 之前用了一段时间博客，比如wo...