1 Bedtools:一个强大的基因组算法工具集 Bedtools是由犹他大学昆兰实验室开发的基因组算法工具集,它堪称是基因组分析工具中的瑞士军刀。Bedtools可以对基因...
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CpG Shores 指的是位于CpG island上下游2kb 以内的区域;CpG Shelves指的是位于CpG shores 上下游2kb以内的区域。
应该一个是上游,一个是下游吧?
甲基化芯片注释中的CpG shores, open sea 是什么
首先推荐Kobashttp://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas3/genelist/[http://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas...
经常我们会遇到gff文件要处理。比如用MCScanX时就要这么处理:第一列为染色体,第二列为geneID,第三,四列为基因的起始和终止的位置。如下图: 这里染色体怪怪的先不管...
旁系同源基因简单来说就是同一物种内,通过基因复制产生的不同的两种基因。 计算直系同源的办法网上已经很详细,今天我来补充一下计算旁系同源基因ks的办法。 最简单方法1 用wg...
文章分别引用自:网易云课堂《用Python自动办公,做职场高手》网址:https://study.163.com/course/introduction/1006277004...
文章引用自网易云课堂《用Python自动办公,做职场高手》网址:https://study.163.com/course/introduction/1006277004.ht...
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请问您指的官方文档是《MicroRNA targets in Drosophila》这篇文章吗?如果不是能否告诉我下,谢谢
miRanda和mirSVR:预测miRNA结合位点的工具欢迎关注”生信修炼手册”! 预测miRNA结合位点的工具很多,以TargetScan为代表的工具,利用结合位点的保守性进行预测,对于大部分保守的结合位点而言其准确性较好,然而...
TME(Tumor Microenvironment)这边打错了
单细胞转录组学习笔记-2-文献理解刘小泽写于19.6.11-文献理解 笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术课程链接在:http://jm.grazy.cn/in...