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Author: Junfei XieDate: 09-10-2021 组织解剖及预处理： 实蝇冰上麻醉，放入75%酒精中消毒3分钟，然后转入PBS清洗； 清洗干净的果蝇放入盛...

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1.用iTAK网站鉴定TF

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1.只要挂载到染色体的基因组序列和注释gff文件 2.构建index 3.EDTA

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准备文件： 1，化石标定的物种关系树 （参考已发表的文献） 改名为input.tree2，mcmctree.ctl文件 记得修改里面的树文件，序列文件路径3，序列文件(ort...

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准备号含有所有蛋白序列的文件夹

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共线性片段是指一个同一个物种内部或者两个物种之间，由基因组复制、染色体复制、大片段复制以及物种分化而产生的大片段同源现象。同源片段内部基因排序保守，意味着功能上也可能保守。 ...

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一，安装circos 二,数据准备 1，计算染色体长度 2，生成染色体文件 7列 karyotype.txt 3, 生成窗口文件 每50k一个窗口 4，计算每个窗口平均GC...

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1 .tar.gz使用tar命令进行解压 解压到指定的文件夹 gz文件 解压 gzip 命令 也可使用zcat命令，然后将标准输出 保存文件 压缩文件为fq.gz格式 3....

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Linux 指令：怎样从文件中找到重复行？1.例如有文件test1.txt，内容如下： 执行uniq -d，发现并没有将重复行输出。原因是uniq只能检测到邻近的重复行，所以...

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1. 命令概述 paste命令会把每个文件以列对列的方式，一列列地加以合并 ，他就是相当于把两个不同的文件内容粘贴在一起，形成新的文件。注意：paste默认粘贴方式以列的方式...

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1，从gtf中提取外显子 提取内含子 3.网站

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用gffread进行转换 1.gff格式转gtf 2.gtf转gff

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之前都是用 fastqc+trimmomatic进行数据质控和过滤，但是fastp更方便也更快，而且可以一次完成质控过滤和出图。 1. Fastp 软件安装 可以直接用con...

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Circos 的核心就是配置文件的编写，在配置文件中，包含两个方面的内容： 数据 参数 作为一款可视化工具，毫无疑问肯定是需要建立在数据的基础上的。有了数据之后，如何展示，会...