1. 数据下载 在读Single-Cell Reconstruction of Progression Trajectory Reveals Intervention Pri...
发简信
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1. 数据下载 在读Single-Cell Reconstruction of Progression Trajectory Reveals Intervention Pri...
你好，请问3.7 气泡图展示上调或下调的配体受体对，横坐标中不同颜色的细胞对是怎么理解的呢？
单细胞分析之细胞交互-3：CellChat常用的细胞通讯软件：CellphoneDB[//www.greatytc.com/p/38a9376f5286]：是公开的人工校正的，储存受体、配体以及两种相互作用...
CellChat 三部曲2：使用CellChat 对多个数据集细胞通讯进行比较分析 加载所需的包[#load-the-required-libraries] 创建目录以保存图...
这个数据包括了10个单细胞样本，但是他们事先将数据合并了，其实我只需要其中的3个样本，所以我需要拆分一下1.加载数据 2.正式拆分，使用tidyverse函数 3.按照样本将...
（1）今天在读取数据的时候，出现一个报错： Warning message:In scan(file = file, what = what, sep = sep, quot...
10× Genomics提供了完整的数据分析方案，单细胞数据转录组分析类似，VDJ数据也使用CellRanger软件进行分析，在使用之前，我们先了解其工作原理如何识别和矫正数...
相关原理详细介绍生信技能树详解GSEA[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247507922&id...
单细胞富集分析系列： 单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程[//www.greatytc.com/p/00f069cb239c] 单细胞之富集分析-2：批量...
单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[//www.greatytc.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...
注意，这里使用的seurat对象要求已经run过runUMAMP()findCluster等函数，否则也没有必要把seurat的结果弄到monocle3的cds对象里 1. ...
常见问题： 1）Seurat CCA整合分析后什么情况下用RNAassay，什么时候用intergratedassay？ conserved cell type marker...
你好，总细胞数2万+，doublets统计3000+，虽然是按比例计算的，但会不会太多了呢？
scRNAseq双细胞去除-1: DoubletFinder10x平台的双细胞率（符合泊松分布1）： 根据Poisson分布，单个液滴包含超过一个细胞（doublets或multiplets）的频率随着上机细胞的浓度而改变。通常如果上...
参考链接:https://github.com/velocyto-team/velocyto.R[https://github.com/velocyto-team/veloc...
*上面由gbk文件中提取出来的信息如下图所示 包含的信息有：1.locus_tag,2.protein_id (可在ncbi的batch entrez中搜索的蛋白access...
在linux上部署项目的时候可能会遇到这么一个错误 错误原因毫无疑问就是分配内存的时候内存不足,但是使用free 命令去查看系统的内存占用却发现此时还有很多内存可用.再使用 ...
