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如果你已经有一个模拟的马尔可夫链序列，并且希望根据这些模拟数据估计转移概率，可以使用频率法或最大似然估计来计算状态之间的转移概率。 1. 获取模拟序列 假设你已经有了一个模拟...

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使用 sample_sequences = defaultdict(list) 和 sample_sequences = {} 创建字典有以下主要区别： defaultdic...

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我们知道conda在环境环境的时候一般采用的方法是： 但其实使用conda安装环境并不限于create -n (或 --name)一种方法，还有一种 -p (或 --pre...

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在扩增子建库过程中，如果不加入PhiX文库，而是在barcode（条形码）位置增加几个错位碱基（即引入少量的随机碱基），可以达到与加入PhiX文库类似的效果。这主要是通过以下...

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在计算置信区间时，使用引导法（Bootstrap）可以采用不同的抽样方法。主要有两种方式：总体数据的有放回抽样和无放回抽样。这两种方法在计算引导法置信区间时有不同的效果和适用...

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一个 Git 仓库常常有不同的分支，开发者可以在各个分支处理不同的特性，或者在不影响主代码库的情况下修复 bug。仓库常常有一个 master 分支，表示主代码库。开发人员创...

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在 Git 中，当你新建了一个本地分支后，需要将该分支推送到远端仓库，以便其他协作者可以访问该分支。以下是具体的步骤： 新建本地分支假设你已经在本地新建了一个分支，例如，名为...

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阿里云服务器安装 Centos 系统后使用 free 命令查看内存大小往往会发现比所购买配置的标称内存要小很多，2G 内存的查出来只有 1756M 左右。 如下图所示（2G ...

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在 GFF（General Feature Format）文件中，基因组特征（features）通常用特定的术语来描述，这些术语定义了特征的类型及其在基因组中的功能。两个常见...

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在酵母（Saccharomyces cerevisiae）基因组中，每条染色体都有两个臂（arm）：左臂（left arm, L）和右臂（right arm, R）。这些臂是...

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在统计学中，进行单因素方差分析 (one-way ANOVA) 或 Kruskal-Wallis 检验后，通常需要进行多重比较分析以确定不同组别之间的显著差异。 以下是常见的...

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要删除远程仓库上的某个文件而不影响本地文件，可以按以下步骤操作： 在本地分支上删除文件：首先，确保你在一个干净的工作目录上（没有未提交的更改）。然后在本地分支上删除文件： 这...