前言 最近在看一些关于生态、遗传、基因组进化等的文献，其中有个很多人用的也用了很久的用以判断物种选择压力的数值，（Ka/Ks）。发现在国内的资料中比较少，即使有，也只是教大家...
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前言 最近在看一些关于生态、遗传、基因组进化等的文献，其中有个很多人用的也用了很久的用以判断物种选择压力的数值，（Ka/Ks）。发现在国内的资料中比较少，即使有，也只是教大家...
Iris 鸢尾花数据集是一个经典数据集，在统计学习和机器学习领域都经常被用作示例。数据集内包含 3 类共 150 条记录，每类各 50 个数据，每条记录都有 4 项特征：...
我管理的基因组学群里，今天有人提出了这样一个问题，如果有多个版本的BLAST，并且都是用conda安装，应该如何调用不同版本的BLAST 对于这个问题，其实存在多种解决方案：...
如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候，大家得到的序列都是单个基因的长度，所以一般都是逐个基因的比较，用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方...
今天登陆简书的时候看到了一个提示，提醒我已经加入简书4周年了。 不知不觉已经写了将近50多万的字（不计代码），也没有想到原来我加入简书正好是五四。 正如当我的粉丝数达到400...
画图时经常遇到不同组的数据大小相差很大，大数据就会掩盖小数据的变化规律，这时候可以对Y轴进行截断，从而可以在不同层面（大数据和小数据层面）全面反映数据变化情况，如下图所示。 ...
文章翻译自Seqtk: code walkthrough 在推特上，Zach charlop-powers请我写写seqkt的代码介绍。这个博客就是简单解释下seqtk。 S...
理解ChIP-Seq 到了目前这个水平，我学习新的高通量数据分析流程时已经不再考虑代码应该如何写的问题了。我更多要去考虑一个技术的目的和意义。 转录组主要研究的问题是基因在不...
