数据准备如果使用在线的Gene sets database，则只需要准备Expression dataset文件(.txt)，Expression dataset annot...
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简介探索性数据分析（exploratory data analysis， EDA）：使用可视化方法和数据转换来系统化地探索数据。EDA 是一个可迭代的循环过程，具有以下作用：...
@d3f0ae2a8c9d 可以直接改成.sra,具体什么原因我也不太清楚，但是它就是我们要下载的sra文件
SRA数据(1)------SRA数据下载一.prefetch下载： 安装SRA Toolkit： 1.下载Toolkit：进入下面的网址，选择适合自己电脑的版本下载，网速不好的推荐挂后台，80M左右，不大。 htt...
加载 tidyverse 时，仔细查看输出的冲突信息，它会告诉你 dplyr 覆盖了基础 R 包中的哪些函数。如果想要在加载 dplyr 后使用这些函数的基础版本，那么你应该...
当使用ggplot2作图的时候有限制坐标轴的范围的需求时可以使用的设置函数有3个：xlim( ) or ylim( )scale_x_continuous(limits = ...
腾讯云镜像：options("repos" = c(CRAN="http://mirrors.cloud.tencent.com/CRAN/[http://mirrors.c...
ggplot2对图例的设置主要为guides()功能下的guide_colorbar()和guide_legend()两个函数： guide_colorbar()函数内部函数...
上次分享我们通过两种方式下载得到了SRA数据，今天就开始对SRA进行处理（以SRR5489805为例）。SRA（Sequence ReadArchive）数据库是用于存储二代...
一.prefetch下载： 安装SRA Toolkit： 1.下载Toolkit：进入下面的网址，选择适合自己电脑的版本下载，网速不好的推荐挂后台，80M左右，不大。 htt...
