使用prism计算显著性,并绘制柱形图: 示例:有4组数据,每组都有4个样本,这种单变量的多组数据之间的比较适用One way ANOVA检验。若是双变量的多组数据则适用于T...
使用prism计算显著性,并绘制柱形图: 示例:有4组数据,每组都有4个样本,这种单变量的多组数据之间的比较适用One way ANOVA检验。若是双变量的多组数据则适用于T...
登录NCBI>点击submit>选SRA>选Project>点New submission 1 SUBMITTER 填写名字,邮件,no group,学校学院,街道邮编国家,...
##########下面做KEGG########emapper <- read.delim("out.emapper.annotations")emapper[emappe...
#这里需要对非模式物种制作ORG.DB包,如果是模式物种,“https://bioconductor.org/packages/release/BiocViews.html#...
#进行功能注释时,我们只用到蛋白文件,就是上一期提取序列的文件“Ptri.protein.fa”。 #使用命令“grep -c ">" Ptri.protein.fa”统计下...
#本教程仿自于“https://zhuanlan.zhihu.com/p/439168788”。#正则表达式教程https://www.runoob.com/regexp/r...
#本教程仿自于B站的15天入门生物信息视频,若有疑惑请以视频为准。若侵请联。 #上一个教程我们得到了genes.counts.matrix.OE_vs_WT.DESeq2.D...
#本教程仿自于B站的15天入门生物信息视频,若有疑惑请以视频为准。若侵请联系删除。 #新开个文件夹,DE,把gene.count.matrix文件丢进里面,编写分组文件gro...
#以下教程主要参考 //www.greatytc.com/p/804ec7cf7cc2//www.greatytc.com/p/b5413ccffe2bh...
#本教程部分文件,来源B站15天入门生物信息教程 “https://www.bilibili.com/video/BV1K44y1B7Dg/?spm_id_from=333....
#1,我们先下载毛果杨的基因组文件和GFF注释文件,自己去NCBI下:(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/genome/GCF_00...
#本教程部分参考B站15天入门生物信息教程,在开启以下教程前,请务必看看我前面两个教程,Linux系统上安装R语言(https://www.bilibili.com/read...
或者使用for循环:
for i in {1..6};
do ascp -vQT -l 500m -P33001 -k 1 -i ~/miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fastp.srsa.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR229/05${i}/SRR2295465${i}/SRR2295465${i}_1.fastq.gz;
done;
Linux系统上安装aspera并用其批量高速下载转录组数据#使用aspera能够帮助我们批量高速下载转录组等数据,现在使用conda进行安装 conda install -c hcc aspera-cli -y #检查是否安装成功,...
以下为Linux系统的基础命令,部分通配符与快捷键,#后接英文标注注释
没有查出序列,就是没有结果
基因家族的鉴定-基于Windows系统上的HMMER基因组的序列提取,详情请看我之前的教程://www.greatytc.com/p/211a262aebc4 基因家族的鉴定-基于windows系统上的本地blast...
#1,现在我有一批文件,原名要被替换成新的名字,我们做一个names.txt文件,前面一列是oldname,后一列是newname,用制表符(\t)分隔,最后空出一行即可: ...
#使用aspera能够帮助我们批量高速下载转录组等数据,现在使用conda进行安装 conda install -c hcc aspera-cli -y #检查是否安装成功,...
#我们在linux系统里面安装R,能够分析许多大数据。前提是安装好conda,可以看教程“https://blog.csdn.net/liangjinghui123/arti...
文章首发于CSDN,B站等,小hong书也有,简书能不能别再疯狂卖广告呀!!! 1,首先需要得到待克隆的基因的CDS序列,上游UTR约250bp,下游UTR约250bp。将上...
原文首发于CSDN和B站,简书,小hong书也有。 1,我们需要测量叶片或其它样品的面积时候,需要用到imageJ软件,拍照的时候记得加个标尺。我们用软件打开图片,File>...