杨博士聊生信

大家好，今天给大家分享一个软件(LDBlockShow)用来绘制LD单倍型块图。在文献中我们经常看到两类图会用到连锁不平衡，一类是LD衰减图，另一类就是LD单倍型块图。需要画...

luly

LD衰减距离指的是，当平均LD系数衰减到一定大小(最大值的一半/0.5以下）的时候，对应的物理距离。通常用LD衰减距离来描述LD衰减速度。LD衰减速度越快，即衰减距离越小，说...

Davey1220

安装并加载所需R包 基本数据格式：SNP名称，所在染色体，SNP位置，Pvalue值 绘制曼哈顿图 基本使用 常用参数 默认绘图 绘制QQ图 默认绘图

生物信息与育种

最近看了不少统计基因组方面的资料，以为懂了，其实懵逼。实在是因为统计学基础太菜，似懂非懂，似是而非。记录下自己的理解，求轻喷。 1.GWAS模型 GWAS是表型和基因型之间的...

Wei_Sun

Title: Identification of soybean phosphorous efficiency QTLs and genes using chlorophyl...

Hello育种

讲座来自：栾生 研究员（中国水产学研究院黄海水产研究所） 1 背景介绍 人缺乏食物，可以来自水产解决，更高的饲料转换率。 研究虾品种介绍： 我国虾的养殖： 其工作的对象： 选...

小潤澤

前言 我们知道GWAS描述的是snp与表型之间的关系，即利用线性模型寻找与某种性状显著相关联的位点。但是发挥生物学功能的往往是蛋白质，蛋白质是由转录本翻译而来，那么建立基因表...