相信很多专题应该已经讲过SCENIC的使用,这儿,针对我自己对SCENIC的学习使用,遇到的问题做一个详细的讲解说明,希望能对大家理解学习应用SCENIC起到一些帮助。 SC...
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文章来源:scenic: single-cell regulatory network inference and clustering github 一、软件安装 安装教程...
一、ScaleData()简介 单细胞基因表达counts矩阵数据经过NormalizeData()归一化处理后,还需要进行scale标准化。ScaleData()[http...
最近对中性粒细胞感兴趣,就多读了几篇文章。分享的这一篇是20年的cell。 HighlightsNeutrophils have variable lifetimes in ...
今年刚发在Advanced Science上的文章,影响因子16.806。 1. Mononuclear Phagocyte Atlas at Single-Cell Res...
我也发现了这个问题,给你点赞
Seurat::DoHeatmap 的谜之报错Seurat::DoHeatmap 的谜之报错 最近在学习Seurat教程(Seurat版本3.0.2),发现运行到倒数第二步做热图展示marker genes时总是报错 主...
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大多数人应该不是中科院预警就行,部分期刊可能是吉大一院预警。 bmc cancer, Cancer Medicine, Frontiers in Genetics, INTE...
那你说个屁
不做生信、不做meta,零科研经费就能轻松发6.6分SCI临床医生发SCI的方法有很多种,有科研经费的可以做实验,没有科研经费的可以做纯生信数据挖掘、meta分析、病例报告等等。现在还有一种不用任何科研经费就可以发SCI的方法,那就...
1. clusterProfiler包,bitr()转换ID函数 clusterProfiler 是Y叔写的一个功能强大的R包,可以用来做各种富集分析,如GO、KEGG、DO...
单臂研究(single arm study):即单组临床试验,顾名思义,就是仅有一个组的研究,没有为试验组设计相对应的对照。部分文章取名为病例系列研究(case series...
CRISPR 首先来介绍一些CRISPR,它首先在大肠杆菌中发现,全称为:Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic ...
最近一直在学习单细胞方面的知识,无意中看到别人的帖子在分享如何画堆叠的小提琴图(StackedVlnPlot),顺便就学习了一下。发现StackedVlnPlot图确实看...
为什么我的rds@meta.data$stim是NULL呢
单细胞亚群鉴定知多少(二)作者:尧小飞审稿:童蒙编辑:angelica 引言 上一期我们详细介绍了几种细胞marker基因的获取方法,为细胞亚群鉴定打好了坚实的基础。在这里我们接着看如何进行单细胞亚群...