IP属地：上海
目前针对QTL分析有很多软件，比如Plink、 Merlin、R/qtl、FastMap等等,今天给大家分享一下如何使用Matrix eQTL进行分析。首先我们先了解一下什么...
求一个OPLS-DA的模型验证 permutation Test的R代码😭
理解OPLS-DA分析的原理和结果图OPLS-DA：正交篇最小二乘法判别分析 原理： OPLS-DA不同于PCA，它是一种有监督的判别分析统计方法。运用偏最小二乘回归建立代谢物表达量与样本类别之间的关系模型，来...
OPLS-DA：正交篇最小二乘法判别分析 原理： OPLS-DA不同于PCA，它是一种有监督的判别分析统计方法。运用偏最小二乘回归建立代谢物表达量与样本类别之间的关系模型，来...
曾经我用 rMATS 进行可变剪切分析，现在我觉得 IsoformSwitchAnalyzeR 更香。 IsoformSwitchAnalyzeR 功能总结如下。 In su...
在实战之前，首先对CHIP-seq分析做一些了解，以下是从各个地方copy过来综合起来的，有些散乱，是我认为重要以及应该了解的知识点。chip-seq 实战就跟在转录组和外显...
【原创】在NCBI查找指定物种基因组信息 生信分析中经常需要查找指定物种的基因组信息。如：基因组相关分析中需要借助已有基因组辅助基因组组装及基因预测；转录组同样查找已有基因组...
【原创】生信分析常见文件格式说明 生信分析中经常会遇到各种格式特殊的文件，例如：fasta、gff、gtf、gbk、m8、sam/bam、vcf 等；本文主要就生信分析中常见...
你好，有个问题请教一下
如果是个非常见物种，最后那个基因注释文件（annotation）要怎么获得？现有基因组序列文件以及GFF文件，感谢🙏
200904 Circ之旅4.1-Circexplorer2Circexplorer2 参考文档： CIRCexplorer2手册 tophat的安装与使用 这个主要记录一下使用Circexplorer2的流程 目前已经通过之前的步骤...
如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候，大家得到的序列都是单个基因的长度，所以一般都是逐个基因的比较，用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方...
