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CIBERSORT的注意事项 CIBERSORT的使用，我们举了几个例子，但是还有一些疑问，只要有疑问在，就感觉心里不踏实。比如：1.CIBERSORT需要什么样的数据？是芯...

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对于sam文件格式，已经有很多人写过相应的中文介绍文章，但是基本上都是简单粗暴的讲了一下每个字符代表什么，但是如果真去研究的话有时候还是感觉有点这些写的还是让人懵逼，比如不知...

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RThe Comprehensive R Archive Network (tsinghua.edu.cn)[https://mirrors.tuna.tsinghua.ed...

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MiXCR GitHub - milaboratory/mixcr: MiXCR is an ultimate software platform for analysis ...

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MetaNeighbor/Documentation.md at master · gillislab/MetaNeighbor · GitHub[https://githu...

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NMF算法简介 非负矩阵分解(Non-negative Matrix Factorization, NMF)的思想可以描述为，对于任意给定的一个非负矩阵V，NMF算法能够找到...

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一、scMetabolism的安装 scMetabolism是一个R包，用于在单细胞分辨率下量化代谢活性，目前只适用于物种是人的单细胞数据。作者推荐使用seurat的数据进行...

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Reference Home · broadinstitute/infercnv Wiki (github.com)[https://github.com/broadinst...

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上一步骤（第6篇：重复样本的处理——IDR）用IDR对重复样本peaks的一致性进行了评估，同时得到了merge后的一致性的peaks——sample-idr，接下来就是对p...

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1 关键细胞类型或Marker缩写： 骨髓多能造血干细胞 HSC 淋巴样祖细胞 lymphoid progenitor cell T细胞抗原识别受体 TCR 抗原提呈细胞 A...

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https://docs.docker.com/engine/install/ubuntu/[https://docs.docker.com/engine/install/u...

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起因：最近有个问题样本，跑完cellranger，样本的cellranger结果如下，细胞数目极高(3W+)。在后续数据质控分析中，线粒体基因占比和双细胞率均很高，用scDb...

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遇到问题，鼠和人的参考基因组，染色体序列名称一样，需要进行区分，不然和gtf对应时有问题 给（fastq,gtf）染色体名前面加上物种名区分

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想学生信原理但是数学不好？不想看一串串公式也想明白各种分析的原理？StatQuest会是一个非常不错的选择！ StatQuest: 该系列视频是北卡罗来纳大学教堂山分校制作的...