之前使用的是3D-DNA流程做Hi-C的辅助组装，它的最大优势就是输出结果可以对接下游的JBAT(juicerbox with Assembly Tools)进行手动矫正。然...
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之前使用的是3D-DNA流程做Hi-C的辅助组装，它的最大优势就是输出结果可以对接下游的JBAT(juicerbox with Assembly Tools)进行手动矫正。然...
ChIP-seq、ATAC-seq等获取到基因组范围内的peak后，需要对其进行基因注释以便进行后续的分析。ChIPseeker做为peak注释的R包，用来很不错，但有时...
参考学习资料：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/GeneOverlap/inst/do...
学习目标 学习用DiffBind流程评估两个样本间的差异结合区域 用PCA评估样本间的关系 评估不同工具得到的差异peaks的一致性 评估差异peaks富集的工具 ATAC-...
简介 wildfly是一个非常强大的工具，我们可以轻松的使用wildfly部署应用程序，更为强大的是，wildfly可以很方便的部署cluster应用。 今天我们通过一个例子...
前几天学习了文献CUT&Tag[//www.greatytc.com/p/335aec753039]，了解了原理以后，可以跟着官网来学习如何分析CUT&Tag数据了...
这次要练习的文章数据出自：Spatially and functionally distinct subclasses of breast cancer-associated...
最近纽约复工，因为每天要做实验（还得全程戴口罩，非常闷得慌），比不了之前每天都在家可以为所欲为的自学生信，所以更新也少了很多~ Hi-C的技术相关背景学习笔记我在之前有写过（...
全文6,743字，阅读30分钟。 这一篇文章的主题是深度学习在基因组学中的应用情况的。文章较长，读完要花些时间，不过我的建议是通读第一部分——关于如何进行模型训练的内容，读完...
