说人话版本: https://www.sci666.com.cn/59227.html
What are eigengenes and gene modules?最近在学习WGCNA时,遇到几个名词不是太懂是什么意思,在网上找了一下,发现有个答案但是正常上网是进不去,所以我就把他拿过来共有需要的人学习学习 one people I a...
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感谢CJ对我上个插件的认可和转发,其实我的求学也不是太励志,由于自己高考不好,所以先上的专科,然后自己的运气不错,把专本硕博上全了,之后感谢导师和学校给我的机会,去国外学了一...
几天前,与CJ讨论,要开发用于转录组基因差异表达分析的插件,当时CJ已经有了想法,我想我就放弃吧,CJ说我们支持多人开发,我想想也对,参考CJ的插件,我添加了一些我的想法,既...
您好 我想问下在进行SERRF运算前是否要对原始数据预处理,比如NA imputation等
非靶向代谢组学数据校正软件之-SERRF@文章翻译自SERRF主页 SERRF是什么 SERRF的全名叫Systematical Error Removal using Random Forest SERRF是为大...
目前富集很多都是用Y叔的clusterprofier,或者使用GSVA,ssGSEA,但是是否还有其他的富集方式,实际上还是有的,不过中文的介绍很少,所以这活只能我来干了。。...
应用场景 得到一组基因后想看这些基因或者蛋白质在uniprot[https://www.uniprot.org/]中亚细胞定位的结果,我们以一个actin基因为例,我们之前从...
首先,vst也是基于负二项分布的一种标准化方法我们为什么在大样本数据中需要采用vst的标准化方法呢?这是因为: 1.It is a one-size-fits-all sol...
as.character(sapply(r[[1]], function(x) sapply(strsplit(x[1], ";"), function(x) x[1])))
没有没有,有老铁私信我简书怎么不更新了😂😂我就粘贴过来了
「TBtools plugin」WGCNA shiny 使用说明原本以为毕业了就起飞了,没想到,喵的比没毕业还累...又鸽了仨月,这个小插件到时完善了不少,但是上次承诺的视频还是没有录。原因不说了,准备手打! 还是写个教程为好。录视频,怕...
原本以为毕业了就起飞了,没想到,喵的比没毕业还累...又鸽了仨月,这个小插件到时完善了不少,但是上次承诺的视频还是没有录。原因不说了,准备手打! 还是写个教程为好。录视频,怕...
test.log里面有报错信息,大概率是包没装上,不要急,关注CJ的公众号生信药丸,最近应该有推文,OneStepWGCNA近期估计要下架,因为最新的WGCNAShiny插件要出了。而且有了更简单的安装插件方法。
『TBtools-plugin』OneStepWGCNA插件这个插件已经下架了,上架了更好用的WGCNA shiny://www.greatytc.com/p/4691c535a522[https://www.jianshu...
还是老习惯,给出官网教程,至于你是看还是不看,它就在那里,等着你的深入研究~ https://horvath.genetics.ucla.edu/html/Coexpress...
WGCNA分析中如何选择软阈值?这次依然还是给你抛出官网教程,依然是:你看还是不看,它就在那里,等着你的深入研究~ https://horvath.genetics.ucla...
👍👍👍写的真好!
小鬼的WGCNA图文详解(一)--软阈值最近有很多人在给他们做完了WGCNA分析之后,跑过来问结果中各种图片的意思。我就整理一下WGCNA分析结果中常见图片的含义吧,如有理解错误,还请各位大神批评指正! 首先,当然...
最近有很多人在给他们做完了WGCNA分析之后,跑过来问结果中各种图片的意思。我就整理一下WGCNA分析结果中常见图片的含义吧,如有理解错误,还请各位大神批评指正! 首先,当然...
clusterProfiler是业界大神Y叔写的R包,看过了它的绘图就会使人沉迷于其颜值无法自拔。本文很多内容直接翻译自官方文档,加上了我的测试数据(还是以果蝇为例)。 一、...