KEGG pathway 注释整理 获得KEGG注释 通过eggnog-mapper和interproscan两个软件(或数据库),可以获得KEGG ORTHOLOGY(KO...
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signatureDB - B cell数据库CancerSEA - 癌症单细胞KIT(肾脏单细胞数据库):http://humphreyslab.com/SingleCel...
介绍 凭借经济高效的全基因组测序和广泛公开的数据,新一代生物信息学方法进入了超高通量领域。例如,最近发表的覆盖度超过30x的 10 多个小麦基因组的组装或用泛基因组取代单一参...
适用背景 在单细胞分析中,必要的一步是对每个细胞进行注释,这相当于给每个细胞打个标签,或者说起个别名,这些信息都存在@meta.data信息里,所以不用特意去更改细胞名字,S...
cell maker cancer cells:EPCAM, CD24, SOX4, KRT18 T cells: CD2, CD3D, TRAC, TRBC2 Treg...
每次解决一个小问题,久而久之,你就解决了一个大麻烦: 单细胞比例的展示,常见的是堆叠柱状图,但是有一个小问题,比较上不明显,那么如果将文字比例添加到图上,那么就一目了然了。使...
作者,Evil Genius 最近见到了很多研究者,真的是不把单细胞轨迹分析当回事,拿到样本不定义直接跑monocle,这能对么?我看了都着急,基本理论要多多学习啊~~~,网...
下载 解压 修改权限 ak和sk是OBS账号提供,endpoint为OBS存储分区
单细胞技术正在加强我们对细胞本身的理解。什么是细胞类型,不就是基因选择性表达的结果吗?而基因的选择表达受到一系列的转录调控,在这个意义上,细胞命运背后的驱动力在于各自转录因子...