这个世界流行离开，但我们却不擅长告别
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双骰儿是一种常见的概率游戏，玩家同时投掷两个骰子，正面数字之和满足某种给定的条件即赢或者输。 假设规则是掷出2或者11，赢得投入的两倍；掷出3，5或者12，投入就成肉包子打狗...
我们经常要用到KEGG数据库来对基因做功能分析。经常有长得好看的朋友问：如何获得整个通路的基因信息？ 其实我们有多种方法可以获得通路中所有的基因情况，本文通过KEGG的原始网...
基因的注释表格是经常需要用到的，可以从GTF文件中获得。用R可以简单地实现这个功能。 简易的GTF文件实际上可以认为是用制表符分隔为9列的TSV。第一列是seqid, 通常是...
表中记录了两家医院在多年间分娩的产妇使用某种药物的信息。要求计算出使用药物的产妇的比例，绘制成如下的图。 我们知道table函数的基本功能，如这里的table(df$"yea...
简单材料： 陈*先生：1965年出生，中国国籍，无永久境外居留权，本科学历。1985年7月至1995年2月，任安徽省安庆市宿松财政局公务员；1995年3月至1997年2月，担...
bedtools bamToFastq
如何从BAM文件中提取fastq虽然高通量测序分析最常用的操作是将fastq比对到参考基因组得到BAM文件，但偶尔我们也需要提取BAM文件中特定区域中fastq。最开始我认为这是一个非常简单的操作，因为sa...
eggnog-mapper实现功能注释 eggNOG-Mapper介绍 通常功能注释的思路都是基于序列相似性找直系同源基因，常见的方法就是BLAST+BLAST2GO， 或者...
上一步我们已经获得了我们用来构树的同源基因集，这里就用这些基因构建系统发育树。我们所需的单拷贝基因和对应的每个Orthogroups的具体信息在SingleCopyOrtho...
enrichplot包实现了几种可视化方法来帮助解释富集结果。它支持从DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler (Yu et al. 201...
