RenJ_9394

@Caspare 可以呀

使用GATK从RNA-seq数据中call variants

GATK官方给出了从RNA-seq数据中寻找变异位点的流程，但这个示意图比较简洁，实际操作时一不小心就会报错，故经过探索，记录下这个流程的细节以及半自动化的脚本。 1. 软件...

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RenJ_9394

@Caspare 如果测序质量很好的话不进行BQSR没关系的 至于VQSR 其实是对变异过滤的方法 一般在基因组测序分析的时候用 RNAseq分析流程中 GATK官方给出的流程是用硬过滤的方法

使用GATK从RNA-seq数据中call variants

GATK官方给出了从RNA-seq数据中寻找变异位点的流程，但这个示意图比较简洁，实际操作时一不小心就会报错，故经过探索，记录下这个流程的细节以及半自动化的脚本。 1. 软件...

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RenJ_9394

@J_445a 主要看后续研究目的吧 我们课题不太关注intron上的变异 所以就没管他们

使用GATK从RNA-seq数据中call variants

GATK官方给出了从RNA-seq数据中寻找变异位点的流程，但这个示意图比较简洁，实际操作时一不小心就会报错，故经过探索，记录下这个流程的细节以及半自动化的脚本。 1. 软件...

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RenJ_9394

面试官的话等于有没有在服务器上装过软件？

服务器 | 又双买了一个服务器

第一个服务器：2016.10 第二个服务器：2018.12 配置流程及问题： 从服务器联系购买，配置，到网络搭建（固定id，同一个路由），到主要分析环境搭建，基本上都是我一手...

溪溪溪溪溪川

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