作者:Resther审稿:童蒙编辑:angelica 1.背景介绍 人体淋巴细胞主要包括T细胞、B细胞。B细胞约占外周淋巴细胞总数的20%,其主要功能是产生抗体介导体液免疫应...
作者:Resther审稿:童蒙编辑:angelica 1.背景介绍 人体淋巴细胞主要包括T细胞、B细胞。B细胞约占外周淋巴细胞总数的20%,其主要功能是产生抗体介导体液免疫应...
通过该网站获取免疫相关基因:https://www.immport.org/[https://www.immport.org/] Resources-Gene lists-G...
前言 干细胞(stem cells, SC)是人体内具有自我复制和多向分化潜能的原始细胞,而这种自我更新和分化为成熟细胞的能力称为干性 肿瘤干细胞 (cancer stem ...
前言 在工业界,天天做着重复的简单工作,已失去了对领域新技术发展的敏感性和好奇心,对技术人员来说这是件可怕的事情。因为没时间,也没兴趣看文献,不能掌握第一手资料,只能在网上找...
无意中发现一篇单基因生信文章,Frontiers in Oncology, 思路很清晰,反复验证自己的观点,可以借鉴模仿下。 PMID: 整体思路 结果 Omcomine探索...
1. 概述 单样本基因集富集分析(single sample gene set enrichment analysis, ssGSEA),是GSEA方法的扩展,主要是针对单个...
做纯生信数据挖掘一定要验证吗?不一定,因为一堆没有验证的文章照样发表了。补充验证一定可以加分?也不一定,看期刊主编和审稿人的。下面这两个案例就是因为补充了验证,差点对审稿人怼...
①免疫细胞浸润与风险值相关性分析 下载infiltration_estimation_for_tcga[http://timer.comp-genomics.org] ②高低...
最近实在太忙了,好久没有更新我们的简书了,今天抽空无论如何也要更新。 示例:查询PDCD1在各个泛癌细胞系中表达情况。 首先我们打开我们的CCLE数据库上网页,网址走起,如果...
上一篇文章我们提到作者有非常好的代码资源,但是数据没有权限下载。因此,我又重新找了一篇文献,使用这个文章的数据来进行m6A图文复现。数据相关文献简要介绍如下: 例子来自于发表...
PCR数据要有三列,一列是组名,一列是内参基因的CT值,一列是目的基因的CT值,计算方法是-2∆∆Ct 法,实现一步出图用的是ggpubr,实现截断则是Y叔出手的ggbrea...
有人会说纯生信SCI是“垃圾论文”,一直忽略它的研究意义,大多数做纯生信数据挖掘的人都是没有钱做验证的,故没有办法证明某一分子是否促进/抑制肿瘤发生发展,更没有办法探索其具体...
生存模型的构建方法包括:1. Lasso回归;2. Cox多因素回归;3. 随机森林;4. 支持向量机 可以把log_rank_test或cox筛选出的基因单独做模型构建,也...
三者的区别训练集(train set) —— 用于模型拟合的数据样本。验证集(development set)—— 是模型训练过程中单独留出的样本集,它可以用于调整模型的超参...