今天有一个需求，就是要将gtf中的转录本转成fasta序列，一开始是想着用bedtools getfasta实现，awk取出来坐标做成bed文件输入bedtools，但是结果...
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今天有一个需求，就是要将gtf中的转录本转成fasta序列，一开始是想着用bedtools getfasta实现，awk取出来坐标做成bed文件输入bedtools，但是结果...
序列比对和序列特征分析总目录 启动子Promoter是位于基因5'端上游的DNA序列，调控基因表达。作用方式是通过与转录因子结合。关于启动子更详细的简文请看查找一个基因的启动...
1. shell 中判断文件是否存在或者是否为空文本 在lunix中写脚本时，总免不了判断文件是否存在，文件内容是否为空的等操作。而这些操作都可以用test指令来实现，可通过...
近使用conda安装包错误，一直报连不上网，后来查看一下原因。是因为清华镜像改了，塞了个文件夹（修改.condarc文件，在后面加上平台名如lunix-64/，win-64/...
海盗湾（The Pirate Bay，缩写：TPB）是由瑞典的一个民间反版权组织海盗署（Piratbyrån）成立于2003年，最初仅为瑞典语站点。后来发展成为独立的组织，2...
最近几天读文献，读到了一篇2019年Andrew D. Young 和Jessica P. Gillung发表在Phylogenomics关于系统发育学的综述Phylogen...
更新：20190319 使用EasyCodeML完成dnds的计算，自己尝试了分支模型和位点模型的计算，简直不要太容易！ 更新：20190314 教程 http://wiki...
前言 最近在看一些关于生态、遗传、基因组进化等的文献，其中有个很多人用的也用了很久的用以判断物种选择压力的数值，（Ka/Ks）。发现在国内的资料中比较少，即使有，也只是教大家...
mpileup是samtools的一个命令，用来生存bcf文件，然后再用bcftools进行SNP和Indel的分析。另外，bcftools是samtools的附带软件。 1...
