欢迎关注”生信修炼手册”! ChIPpeakAnno是一个bioconductor上的R包,针对peak calling之后的下游分析,提供了以下多种功能 查找与peak区域...
1、TAIR,The Arabidopsis Information Resource, TAIR 图片来源:https://baike.baidu.com/item/TAI...
NCBI简介 NCBI全称National Center for Biotechnology Information,(国家生物技术信息中心)是隶属美国国家卫生研究所的国家医...
在实战之前,首先对CHIP-seq分析做一些了解,以下是从各个地方copy过来综合起来的,有些散乱,是我认为重要以及应该了解的知识点。chip-seq 实战就跟在转录组和外显...
哈哈,搜了一圈没发现网上有关于MAnorm的中文教程或者是说明,本文将是第一篇~撒花✿✿ヽ(°▽°)ノ✿那就要用心写了,感到鸭梨.jpg== 首先,MAnorm是什么,可以做...
笔者以前没重装过系统,大学太懒了,连windows系统也没重装过,公司要用CentOS7作为服务器,让我拿一台旧机重装下Linux系统,今天写下安装步骤,如有坑和不足之处,还...
开篇致谢:下面内容的整个框架是跟着生信技能树发布在bilibili上的ChIP-seq视频学习的,链接:https://www.bilibili.com/video/av29...
官方参考 https://deeptools.readthedocs.io/en/develop/content/installation.html 下载安装 python ...
给自己的记录,方便下次查阅! 测了一些ChIP-seq的数据,除了拿到公司的套路分析结果以外,想要做一点自己想要的分析,但是有没有基础,上了生信技能树的入门课,然后就在网上各...
1.想要画一个chip-seq的热图,首先要通过bamcompare获得针对IP和input样品的处理后的bigwig文件, 通过运行命令 bamcompare -b1 IP...
以下罗列了ChIP-seq数据分析中的ENCODE标准,针对不同的免疫共沉淀类型有不同的标准,以下从组蛋白和转录因子2个方向介绍: 一、组蛋白 生物学重复: 至少2个 抗体:...
这一次,我们来聊聊基因组注释。首先问自己一个问题,为什么要进行基因注释。就我目前而言,它用来解决如下问题: 在mapping-by-sequencing的时候,我找到了一些可...