许四书

要查询以往的 GWAS 研究结果，可以使用 GWAS Catalog。GWAS Catalog 包含的信息非常多，不过有时可能满足不了需要。介绍一个叫 CAUSALdb 的数...

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原谅我又拖更好久，没办法，欸，就是懒，但是所有的单子都是保质保量完成的哈。，今天给大家写工具变量和孟德尔随机化，文章略微有些长，请大家准备好清醒的头脑，和半个小时的阅读时间哈...

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1 统计功效（power）概念 统计功效（power）指的是在原假设为假的情况下，接受备择假设的概率。 用通俗的话说就是，P<0.05时，结果显著（接受备择假设）; 在此结论...

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孟德尔随机化推断暴露因素与健康结局的因果关系[//www.greatytc.com/p/8ac31267d3d8] 主要步骤：1. 读取暴露因素GWAS数据选取合适...

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之前和大家多次聊过参考文献的排版。👇 Zotero | 有了Zotero，参考文献排版不再烦恼！ 定制版GB/T 7714来了，究竟有多好用？| Zotero 今天继续介绍...

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写在前面 很多时候，我们做完转录组，会想着看看样品与样品之间的表达相关性如何？依此，可以看看是否存在异常样品，也或许可以找到一些生物学相关问题。常常，我会使用 R 语言的 C...

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平时对于网络图的绘制，一般我们都会在R中生成边和点列表后导入到Cytoscape和Gephi等的本地工具软件当中，而R语言中也自带有不少优秀的包也可精美的可视化我们的数据，所...

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GOplot | 更美观的富集分析可视化 数据准备 GOplot使用了zscore概念，但其并不是指Z-score标准化，而是指每个GO term下上调(logFC>0)基因...

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本文的部分内容来源于“Comprehensive evaluation and characterisation of short read general-purpose ...

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前言 最近在研究低深度WGS数据检测SV变异，测试了很多个软件，一直没有一个准确的结论。周一很巧地发现了这篇文章，作者收集了市面上几乎所有的SV检测工具，用真实数据和模拟数据...

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大家好，本周给大家分享的是近日发表在PNAS上关于与蚂蚁群体性别比例和社会结构相关的连锁超极基因的一篇文章。 文章题目：Linked supergenes underlie ...

许四书

接触全基因组关联分析（GWAS）已经一年半有余，从刚开始对GWAS的全然无知到现在慢慢了解，越来越能体会到这项技术的了不起。同时，越来越多的科研工作者也在使用这项技术，然后就...

许四书

写在前面 今天是周二，吃完午饭回到电脑前，想着看个动漫休闲一下。But，我还是忘了网址到底是啥？对于一个没有做网页收藏夹的人来说，确实是麻烦。类似的场景常常发生在： 下载文献...

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扩增子一站式分析平台QIIME nature||qiime 2018年1月QIIME2全面接档QIIME1 极简操作 QIIME2是微生物组分析流程QIIME的全新版,采用P...

许四书

到底还是写了一篇推文，却着实想不到一个合适的题目。可能这是我写过最长的一篇推文，约莫万字。这篇推文的主要内容应该包括： TBtools 开发为了什么？ TBtools 是怎么...