如果从TCGA官网网页下载数据,或者使用gdc-client工具下载的数据,都是以单个的文件夹形式存储,并且文件夹中的为压缩文件,所以,下载数据后,第一步就是如何把这些文件复...
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如果从TCGA官网网页下载数据,或者使用gdc-client工具下载的数据,都是以单个的文件夹形式存储,并且文件夹中的为压缩文件,所以,下载数据后,第一步就是如何把这些文件复...
本来说这期是要更新LncRNA鉴定思路的,但是看到上一期人气低迷,就暂时晚点在弄了,这次就来跟大家分享一下火山图 什么是火山图? 顾名思义,火山图就是一个长得有点像火山的图形...
如想获得图例代码和数据,请到公众号“小杜的生信筆記”中回复“20220117”,链接有效期2022.17-2022.2.17(特别申明:该数据仅是演示数据,无任何意义) 教程...
导读 利用富集分析,我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如:TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...
做生物信息分析,少不了的就是数据,比如转录组的数据,无论是下载的还是测序的,用R进行分析,就必须将这些数据读入,分析的结果,比如一些图,就少不了输出,因此,文件的读写在数据分...
一 基础知识 1、什么是富集分析? 富集分析的原理一个生物过程通常是由一组基因共同参与,而不是由单个基因独自完成。富集分析的基本前提假设是,如果一个生物学过程在已知的研究中发...
用Circos华丽地展现基因组信息,能给论文的锦上添花。很多做基因组分析的文章必有一个点就是展示基因组的圈图,目前的去比较好实现这种可视化的一般依靠perl语言(最原始的版本...