土豆_leah

本篇简单介绍3D基因组在近期主流的两个获得数据的手段：Hi-C及ATAC-seq。 首先需要理清几个概念： 1. 染色体疆域（Territory）：指每条染色体都占据着一个独...

周运来就是我

空间转录组学技术在复杂的生理、病理条件（直接切片还是有设计地切片？）下研究不同位置区域细胞的异质性，特别是针对肿瘤和干细胞生物学，发掘具有独特分子特征的细胞群落，研究其对信号...

小潤澤

这篇文献是今年12月份发的，也就是一个星期前，是刘小乐教授推荐阅读的 推特地址： 本篇文章讲解了单细胞RNA-seq的一般分析流程，当然文中还推荐了分析的课程：单细胞课程[h...

小潤澤

《Orchestrating single-cell analysis with Bioconductor》[https://www.nature.com/articles/...

空山fine

Web Scraper 是一款免费的，适用于普通用户（不需要专业 IT 技术的）的爬虫工具，可以方便的通过鼠标和简单配置获取你所想要数据。例如知乎回答列表、微博热门、微博评论...

小贝学生信

我所理解的cellranger软件理想原始输入数据就是SRA格式，然后利用sra-tools分为read、barcode+UMI、index三个fastq.gz文件。最后直接...

Ray钱

CHIRP(ChromatinIsolation by RNAPurification)是一种检测与RNA绑定的DNA和蛋白相互作用的方法，可同时分析lncRNA/circR...