你好,比对后共有序列含有数字是啥含义呀?
利用GeneDoc美化同源比对结果软件准备:GeneDoc下载地址http://www.jalview.org/getdown/release/[http://www.jalview.org/getdown/...
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之前有一次,我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”,因此,我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后,最终用ggplot2画了。。。其它方法简单地...
01-Definition Genetic Distance Genetic distance is the degree of genetic difference (ge...
2020.11.9【GWAS/WGS流程】丨全基因组关联分析绘图全流程_穆易青的博客-CSDN博客_gwas全基因组关联分析[https://blog.csdn.net/ya...
博主,我运行admixture,没有结果文件.P和.Q,也不报错,不论是.ped还是.bed作为输入文件,都没结果,救救孩子吧
Linux 安装admixture1、安装VMware tools或挂载共享文件夹2、下载anacondahttps://repo.anaconda.com/archive/[https://repo.ana...
对于最适m值会有多次重复,那么绘制树图时最适m值的第几次重复可以当做最后结果呢?每一个重复的结构都不太一样
【群体遗传】Treemix四倍体分析 & 最优m值选择距离上一次写博客,已经是上一次了。 之前已经有生信菜鸟团前辈写过关于Treemix的分析,但值得关注的是,现在的软件大部分都只适用于二倍体,那今天介绍一下四倍体怎么进行Tre...
距离上一次写博客,已经是上一次了。 之前已经有生信菜鸟团前辈写过关于Treemix的分析,但值得关注的是,现在的软件大部分都只适用于二倍体,那今天介绍一下四倍体怎么进行Tre...
基因流(也称基因迁移)是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质,从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因,是遗传变异一个非常重要的来源,...
群体结构是指材料的亚群分化情况,会导致标记间的非连锁关联,进而导致关联分析结果出现假阳性。 地理隔离、人工选择、移民和遗传漂变等都可能导致群体分化。 是指遗传变异在物种或群体...
谈起Plink相信熟悉的人更定都会知道,这是一个全面的基因组分析工具集,具有很多的小功能,在SNP数据统计,过滤,GWAS分析中都可以用得上,而且速度非常的快,堪称是生物信息...
同求,超到的ks咋过滤
全基因组复制分析(WGD)全基因组复制 全基因组复制事件是物种的染色体由于某种原因整体复制加倍的事件; 大多数被子植物都经历过多倍化事件; 物种在自然选择压力较大的时候可能会发生全基因组复制来丰富自己...
您好,请问最后一步ks.R的脚本可以分享下吗?
个性化需求 鉴定得到的wgd gene pair,TBtools计算得到TBtools.kaks.tab.xls,绘制Ks为横坐标,Ka为纵坐标的点图,对各数据进行分别以斜...
Tajima D 这个是选择相关的一个参数,大于0代表群体观测杂合度高于预期杂合度,稀有等位基因频率降低(群体收缩或者平衡选择),小于0说明群体观测杂合位点少于预期值,稀有等...
0.仅作个人笔记使用意思就是只考虑我能不能看懂具体每个参数的含义参照官方文档, 这里全部用默认参数https://wgdi.readthedocs.io/en/latest/...
我进行ksd分析时,报错:AttributeError: type object 'object'has no attribute 'dtype',不知道啥问题,求助!
使用WGD鉴定全基因组复制转载自链接://www.greatytc.com/p/3cfeb49c821a[//www.greatytc.com/p/3cfeb49c821a] 古老...
这篇对于全基因组复制的介绍非常的详细,收获颇多,感谢分享。