背景 feature 定义:基因组上对具有不同性质区域的定义 (例如:gene/exon/intron/miRNA等)。 优点:利于分类整理结果。 两类测序bias 长度bi...
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前言 今天来跟大家分享一个smallRNA的分析流程——sRNAnalyzer[http://srnanalyzer.systemsbiology.net/]。这个流程是...
Emmm, 今天的主图, 写在前面 博士毕业论文中,使用的样品包括: 不同的类型 / 或者说不同的组织 不同的时间 / 或者说时间序列所以,是一个多X多的设计。对于这类实验设...
出发点: 源自Single cell RNA sequencing to dissect the molecular heterogeneity in lupus nephr...
目标 通常比对好的bam,如果需要重新比对,需要将文件转成原始的测序文件的格式fastq。通过bedtools中的bamtofastq 能够将文件转成fastq bedtoo...
刘小泽写于19.6.8之前最开始学习IGV的时候写过两篇推文,当时简单做了了解,但有朋友说意犹未尽,嗯我也这么觉得,总觉得还是学的不够。推荐阅读:https://github...
Micro RNA参与许多的生命调节过程,是近十年来的一个研究重点。 这次介绍:1.small RNA建库测序方法2.small RNA的生物信息学分析 表达量差异分析 聚类...
1. linux 学习:http://wiki.jikexueyuan.com/project/learn-linux-step-by-step/ 2.python:http...
整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 一般而言,我们获得了MACS的peak calling结果时,我们会想探...