最近在后台有不少读者留言想要了解一下网状meta分析，而我恰好前两天帮一位医生朋友处理了一次连续型变量的网状meta分析，那么本文我将以其中的部分数据为例，向大家详细展示一下...
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TCGA数据库中含有的癌症名称，简写和中文名称 Abbr英文名称中文名称ACCAdrenocortical carcinoma肾上腺皮质癌BLCABladder Urothe...
【R与R Studio】2021.10.111、R语言是一门用函数处理数据的编程语言。 2、RStudio是R语言的集成开发环境，打开后页面可见脚本编辑器（写代码的地方）、控...
一、🌽 玉米: ZEAMAP[http://www.zeamap.com/zmap_tissue_expression]，需要注册才能下载tsv数据。Zeamap Tissu...
目标二：数据预处理，探针ID转换，探针去重1、数据预处理自动log2化，解释 以上代码在GEO官网可查。 2、探针基因名转换platformMap.txt中有常见的平台各R注...
目标一：下载GEO数据，以GSE42872为例方法一：通过加装GEOquery包，使用getGEO函数可以得到对应GEO好的表达矩阵，注释信息，样本信息等。 此步骤Run后下...
如何判断芯片表达矩阵是否需要均一化 以GSE43292为例https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE4329...
通过加载GEOquery包，使用getGEO函数可以得到对应GEO号的表达矩阵，注释信息，样本信息等。以GSE76275为例。 然而由于网络等问题，getGEO函数可能会出错...
作者：白介素2 这一节的内容包括应用 GEOquery包下载芯片数据，提取表达矩阵，提取metadata信息。解决一个探针对应多个基因的问题 GEO数据下载-GEOquery...
笔记说明 tidyr包是一个用于整理数据结构的r包，也是tidyverse的核心包之一。本次笔记介绍tidy data、长数据、宽数据的相关概念以及用于长数据、宽数据相互转换...
2021.9.22中秋节后新的练习开始啦~练习用的是“nycflights13”的数据。 目标：学习数据选取的三种思维模式 【一】通过位置获取 【二】通过行名和列名获取 20...
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2021.9.16题目：已有信息ensembl_id，找到对应的基因名(symbol)思路：通过ensembl_id确定gene_id，再通过gene_id确定symbol。...
