从cellrange开始,修改文件名为适用格式scrna-filename.txt里是文件名命令cat scrna-filename.txt | while read i ;...
一、外显子测序分析可以得到以下结果: 变异位点的检测和注释 基因突变的检测和注释 拼接剪接位点的检测和注释 基因外显子区域的覆盖度分析 基因外显子区域的差异表达分析 基因功能...
根据这个教程,在make这步报错,先是utils.c:33:10: fatal error: zlib.h: 没有那个文件或目录可以apt install gcc解决,再次m...
突然就这样了,并且kernel error或者连不上 重装内核会报: 按照网上的方式修改kernel.json里的路径不行 然后发现python默认版本变成了2.7,查看虚拟...
一共30个样本,要出弦图,先在jupyter里批量运行了PlotFancyVJUsage: 之前是在产生的错误文件(vj_pairing_plot.r)之里修改内容后一个个样...
下载了恒河猴的pep(蛋白质)数据库(https://ftp.ensembl.org/pub/release-108/fasta/macaca_mulatta/pep/[ht...
.ProtocolError: ("Connection broken: ConnectionResetError(10054, '远程主机强迫关闭了一个现有的连接。', N...
@明远鸢 是的老师😂
安装SeuratData的解决办法想要LoadData("ifnb")需要library(SeuratData),但是devtools::install_github('satijalab/seurat-da...
想要LoadData("ifnb")需要library(SeuratData),但是devtools::install_github('satijalab/seurat-da...
得到VJ的table后,用前两列和count或者freq(最好freq),分别作为"TCR1", "TCR2","value" 我发现最近总忘记写简书
先用excel算出两组数的平均值μ1和μ2,=STDEV(选中所有数据)算出均方误差:MSE,也就是σ^2=SQRT(MSE) 均方误差开根号: σd=(μ1-μ2)/ σ
预期效果: 在github上找到tcrdistGitHub - 普布拉德利/TCR-dist:用于分析表位特异性T细胞受体(TCR)库的软件工具[https://github...
在linux下先放gz文件,用perl脚本,注意输入示例为3B.clonotypes.TRB.txt,表头是:count freq cdr3nt cdr3aa ...