11的雾

scHLAcount允许我们使用个性化的参考基因组计算HLA I类基因HLA-A、B和C的单细胞转录组序列数据中的分子数；和HLA II类基因DPA1, DPB1, DRA1...

单纯的学生信

1、下载GSE115850数据 2、读取数据且处理数据，数据格式是这样的： 接下来是要把行名改成基因名，又因为行名只能是唯一的不能有重复，所以要把多个Ensembl对应的同一...

cc的生信随记

批次效应（batch effect），表示样品在不同批次中处理和测量产生的与试验期间记录的任何生物变异无关的技术差异。其既可能来自实验，也可能是来自分析流程。实验中样品收集、...

像鸟一样飞过你的高山

批次效应 批次效应是测量结果中的一部分，它们因为实验条件的不同而具有不同的表现形式，并且与我们研究的变量没有关系。不同平台的数据，同一平台的不同时期的数据，同一个样品不同试剂...

Davey1220

Palantir是一种对单细胞测序数据进行分化发育轨迹推断的算法，于2019年发表在Nature Biotechnology上。Palantir将细胞分化模拟为一个随机的过程...

单细胞空间交响乐

今天给大家分享一个用于拟时分析的软件Palantir，当然，目前拟时分析的软件已经有很多了，至于哪个适合于你，就要看你的目的和结果是否符合你的预期了。Palantir是202...

Davey1220

Palantir是一种对单细胞测序数据进行分化发育轨迹推断的算法，于2019年发表在Nature Biotechnology上。Palantir将细胞分化模拟为一个随机的过程...

Hayley笔记

scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[//www.greatytc.com/p/0127c9b380c9] 免疫细胞注释-2：髓系细胞[http...