生信师姐

转录因子 (transcription factors, TFs) 是直接作用于基因组，与特定DNA序列结合 (TFBS/motif) ，调控DNA转录过程的一类蛋白质。转录...

微生信

富集分析是生物医学论文中非常常见的一类分析，例如GO富集分析，Pathway富集分析等。其结果一般包括以下几个要素：1，名字（GO term或者KEGG descriptio...

佳奥

这里是佳奥！我们继续clean数据的比对。 1 使用bowtie2进行比对 用bowtie2进行比对和统计比对率, 需要提前下载参考基因组然后使用命令构建索引，或者直接就下载...

小明的数据分析笔记本

论文 A latitudinal gradient of deep-sea invasions for marine fishes https://www.nature.co...

Bioinfor生信云

背景 基因组测序现在已经成为生物学研究的一个重要手段，基因组的杂合度和重复序列对后续基因组组装有很大的影响。高杂合的基因组往往无法合并姊妹染色体，导致组装的结果偏大，而重复序...

小明的数据分析笔记本

deepTE的github主页 https://github.com/LiLabAtVT/DeepTE[https://github.com/LiLabAtVT/DeepTE...

Bioinfor生信云

基因结构注释的方法包括： 从头预测根据基因结构的特征，基于算法（大多为隐马尔可夫模型）进行预测 蛋白注释根据物种自身（或近源物种）的蛋白序列，进行注释 EST 注释根据物种自...