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更新于2020.10.27 二代测序方式分为三种:single read 单端测序paired-end read 双端测序mate-pair read 配对测序 虽然有三种方...
Part1 数据下载 先去Korean Personal Genome Project下载了编号为KPGP-00001的数据。 先说一下KPGP吧,中文名叫韩国个人基因组计...
参考:碱基矿工从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第4节 构建WGS主流程GATK4.0和全基因组数据分析实践(上) 前言 由于人类基因组数据过大(我的小小服务器也只有50...
需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件,并且用fastqc软件测试测序文件的质量!作业,理解测序reads,GC含量,质量值,接头,in...
# 方法一 本地拷贝并打包R包,复制到另一个R的对应的R包library目录下(.libPath查看包路径) # 方法二(变量名自定义) pkged <- installed...
懂了,RMA是经过log转换的,MAS5没有
判断GEO芯片数据表达矩阵是否需要log2转换通过exprs函数获取表达矩阵后我们可以通过以下三种方法判断是否需要进行log2转换 1.肉眼识别 最简单粗暴的方法就是,根据数值大小粗略估计:如果表达量的数值在50以内,通...
谢谢作者!
R语言20练习题【完整版】刘小泽重新写于2018.9.3练习题来自生信技能树jimmy,http://www.bio-info-trainee.com/3409.html再次基础上进行加工、重构,加入...
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