菜鸟呦忧

今天分享一篇，最近发在《Plant Cell and Environment》的通过单细胞来揭示橡胶树应答白粉病早期侵染的文章：“Single-cell transcript...

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其实转录组现在很普及了，一个样品的测序价格也非常低。转录组的作用几乎如同于PCR一样常见，在很多文章中只是一个验证的作用，很少有文章单纯靠转录出发做一个研究，除非你有非常好的...

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DNA顺式作用元件的认识、查找、分析，一tiao龙服务！ 1.顺式作用元件的基础知识 ① 顺式作用元件（cis-actingelement）是什么？ 答：具有转录调节功能的，...

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转录组是一类让人既爱又恨的项目，实验门槛低，却是文章泛滥的重灾区，总有人问小编，现在转录组还能发文章吗？下面小编就借一篇2020年5月4日发表在BMC Genomics上题为...

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我是在找snakemake参考资料的时候找到的这本在线电子书，链接是 https://eriqande.github.io/eca-bioinf-handbook/[http...

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写在前面：经常做转录组分析，就是把差异基因搞个火山图和Venn图看各组差异基因的共有和特有情况。看见有个比较好的选择，能直观比较各种处理带来的影响，如下： 来自Nature ...

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人非生而知之者，无论是生活中还是科研中都会遇到各种陌生事物和难题，比如这种： 或者是这样的： 此时你的心情可能是这样的： 做科研的时候碰到了这种难题，又没有系统指导的话，很可...

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如何从海量高通量测序数据中筛选出目标数据？这是困扰大多数老师的一个难题！ 小编以一个excel的简单函数为例，演示一下如何从表格中快速筛选感兴趣的基因等信息。 函数的名称是V...

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随着测序成本的下降，转录组测序已经逐步成为分子生物学实验的标配，每年有大量的数据产出，这也导致了转录组测序分析的文章越来越难以发表。 今天小编就给大家带来一篇今年10月份见刊...

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测序容易，解读困难 现在大部分同学做转录组实验都是让测序公司去分析，经过了那么多年的发展，公司提供的分析结果也是越来越丰富了，光结题报告就有几十页，结果文件有几百兆甚至超过1...

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写在前面 常做分子实验的小伙伴们，一定都离不开引物设计，其重要性我相信不用多说。而在我们设计引物的过程中，引物的特异性往往决定PCR的产物是否有杂带，从而影响下游实验，直接影...

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写在前面 小时候，我在 TBtools 中写了一个功能，“Primer Check (Simple e-PCR)” 。可以用于简单的 PCR 引物特异性检测，需要用户提供两个...

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写在前面 今天休息了一天，大体学了一下一直有想法学，但是没时间学的东西。结果就是，太难了。时间有限，还是放下。但今天还剩下三个多小时，总得做点啥。看看，似乎今天没写啥推文。于...

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写在前面 以前总看到问题是，基因结构可视化的问题；现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单，也比较玄乎，所以我一直不是太乐意与别人讨论。但学院今天断网，手上的...