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R Markdown Workshop 背景 这对我来说是一个不寻常的帖子，我之前试图避开写关于R Markdown的文章，因为这个主题已经有很多资源可用（例如RMarkdo...

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将您的R shiny应用程序提升到新的水平 - 我们的开源概述在Appsilon，在为我们的客户开发项目时，我们经常遇到经常性的挑战。这促使我们创建简化开发过程的解决方案 -...

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对于我们分析者来说，传统转录组的分析软件，如top hat,cufflinks,hisat2,htseq,是不是不适应于单细胞测序了

单细胞测序的知识

刘小泽写于18.7.20https://hemberg-lab.github.io/scRNA.seq.course/index.html 介绍 Bulk RNA-seq: ...

刘小泽

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我下载的转录组数据有的是 hg19注释的，有的是 hg38，有啥比较便捷有效的方法统一吗，还是我最好都重新注释一下

基础知识复习之比对

刘小泽写于18.11.30一般我们得到原始数据、质控过滤后，要么进行比对，要么序列拼接。序列比对的话可以选择参考基因组、参考转录本，目的就是看看测序的reads分布在什么位置...

刘小泽

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学长，我对转录组特别感兴趣，但是我老师说转录组交给公司做就可以了，没有意义，我该怎么回答老师😄

基础知识复习之比对

刘小泽写于18.11.30一般我们得到原始数据、质控过滤后，要么进行比对，要么序列拼接。序列比对的话可以选择参考基因组、参考转录本，目的就是看看测序的reads分布在什么位置...

刘小泽

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学长您好，想请问学长一个问题。全转录组测序的方法(我记得是去除核糖体）能得到同一个样本中很多rna的表达量，但是它是不是测不到miRNA，(因为它太短了）。我记得miRNA测序需要大小切胶和beads筛选的方法单独测，如果要想公共数据库挖掘得到mRNA与miRNA的关系必须得是找同一个样本同时测了两种rna的数据，没有别的方法吧。

生信基础知识复习之测序

刘小泽写于18.11.25每学习一遍之前的知识，总能从不同角度获取一些观点，然后扩增自己的知识库，这就是“知识迭代”这次我也就是想到哪写到哪，把自己认为重要的内容梳理下，用Q...

刘小泽

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虽然很久以前就看过很多测序原理介绍，但是看了豆豆学长花花学姐总结的资料还是总结的很全面很通俗易懂的，收获很大，感谢😄

2018-10-14 测序基本知识

1##一代测序sanger测序，双脱氧核苷酸ddNTP会结合所有位点，设置四个反应体系1-4，分别加入引物、DNA聚合酶、四种dNTP、一定比例的ddNTP（带有放射性标记）...

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1##一代测序sanger测序，双脱氧核苷酸ddNTP会结合所有位点，设置四个反应体系1-4，分别加入引物、DNA聚合酶、四种dNTP、一定比例的ddNTP（带有放射性标记）...

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@小洁忘了怎么分身 这周太忙了，，实在干不过来，并且R的我用的还是挺长时间了。等我忙过了这段的

2018-10-13 R包的学习

1.获取帮助信息的方法 方法1：去百度/谷歌XX小抄方法2：找Rstudio的cheatsheet网站（网速好慢的） 2. 学习tidyr包 2.1数据框的建立 2.2 ti...

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