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欢迎批评指正 一、上游处理流程 上游处理步骤包括质量检测、质量控制、比对、定量[2],每一步处理数据的目的都是不同,也有相关的软件与之对应。通过...
featureCounts --help
经过了第四节的长文,我想大家基本上已经知道了一个WGS流程该如何构建起来了吧。但在那一节中限于篇幅有两个很重要的文件我没能展开来讲,分别是:BA...
在WGS数据的分析过程中,我们会接触到许多生物信息学/基因组学领域所特有的数据文件和它们特殊的格式,在这一节中将要介绍的FASTA和FASTQ便...
rsem-calculate-expression --help
STAR --help
一、准备RNA-seq数据 需要参考基因组文件,注释文件,样本的fastq.gz文件 检查fastq.gz是否完整 二、fastqc生成质量报告...