批次效应 是指在实验中由于不同的实验条件、操作人员、试剂批次、设备差异等非生物学因素引起的系统性差异。具体来说,在单细胞RNA测序(scRNA-seq)中,不同的实验批次可能...
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效果图 Signac中的 CoveragePlot是一种用于展示基因组覆盖度的图形工具,常用于 ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessib...
作者,追风少年i 最近一直有人问我空间转录组的饼图该如何绘制,如下图 之前呢,说过一些,大家可以借鉴 10X空间转录组绘图之细胞类型百分比饼图和空间密度分布图[https:/...
软件快照: https://github.com/yuqiuzhou/Pianno[https://github.com/yuqiuzhou/Pianno]官网快照软件介绍:...
富集分析经常做,之前只知道GO term有从上到下的层次关系,今天才知道KEGG pathway也有类似的分层关系。 起因是我准备更新一下自己的kegg富集结果展示图,之前一...
方法1 数据库软件 timesaveR 优缺点:在线数据库检索,更新及时,效率较低 实测10000个SNP位点的检索耗时约 3 mins 方法2 本地数据库 SNPlocs....
单细胞转录组测序的差异基因表达分析是一种用于比较不同细胞之间基因表达水平的方法。在单细胞RNA测序数据中,每个细胞的基因表达水平都被测量,并以基因计数矩阵的形式进行存储。差异...
场景说明:多进程文件拷贝是提高文件拷贝效率和速度的关键方法。通过同时启动多个拷贝任务,系统能够充分利用资源,实现大规模文件的并行传输,显著加快了传输速度。这在数据备份、文件同...
摘要:本文记录了在Win10系统在Rstudio平台中使用 reticulate 为 Seurat::FindClusters 链接Python 环境下的 Leidenal...