可以用于单细胞分析吗？
R语言分析4：一致性聚类分析（ConsensusClusterPlus）一致性聚类是一种提供定量证据的方法，用以确定数据集中可能的聚类的成员及数量，例如微阵列基因表达。这种方法在癌症基因组学中得到了广泛应用，以发现了新的疾病分子亚类。一致性聚类方...
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可以用于单细胞分析吗？
R语言分析4：一致性聚类分析（ConsensusClusterPlus）一致性聚类是一种提供定量证据的方法，用以确定数据集中可能的聚类的成员及数量，例如微阵列基因表达。这种方法在癌症基因组学中得到了广泛应用，以发现了新的疾病分子亚类。一致性聚类方...
ssGSEA是一种常用于免疫细胞浸润分析的方法。该方法通过将每个样本的基因表达数据与特定的基因集（免疫细胞基因集）进行比较，来估计该基因集在该样本中的相对富集程度。 2. 使...
作者，Evil Genius 偷个懒，不看文章了，总结一下关于WGCNA的分析内容。 WGCNA运用很广，在文章中一般作为补充分析存在，例如下面的结果 还有单细胞空间联合的W...
接上一篇，pySCENIC分析完之后就可以进行可视化[https://so.csdn.net/so/search?q=%E5%8F%AF%E8%A7%86%E5%8C%96&...
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识，不断记录反思，也...
背景：单细胞ATAC分析流程介绍。 1.为什么做单细胞ATAC分析？ 单细胞转录组分析的是单细胞分辨率上不同细胞之间的转录组（mRNA）差异，由中心法则可以知道，生物发生的过...
cellDancer：一种基于模型的深度神经网络（DNN）框架 已知：mRNA的转录动力学由转录速率（α）、剪接速率（β）和降解速率（γ）决定，未剪接和剪接mRNA之间的平衡...
一、数据整理 1 导入数据 利用data.table包导入数据，以LUAD为例 2 选择感兴趣的临床信息 一般常规项包括submitter_id，vital_status，t...
分析过程 以rela基因为例，featureCounts结果文件“all.id.txt”中提供的信息为： 接下来用R语言进行分析:1. 提取featureCounts结果中的...
TCGA学习01：数据下载与整理 - 简书 [//www.greatytc.com/p/79816a20cbb1]TCGA学习02：差异分析 - 简书 [htt...
引言：本文主要记录mRNA生存分析过程中遇到的问题以及具体过程，生存分析用的是最常见的KM法Kaplan-Meier。 工具：TCGA的数据通过library(TCGAbio...
最近看到Fly Cell Atlas (FCA) 公布果蝇的多个组织的单细胞核转录组测序数据，虽然FCA组织提供了多个在线平台（例如SCope）进行非常方便的可视化和多种分析...
