下载NCBI数据,使用ascp命令是最快的,但是小编之前尝试用该命令下载SRA数据,查阅了百度上的各种参数,最后还是没有成功,可能是有个“墙”存在的原因,小编后来有一段时间使...
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CNCB(China National Center for Bioinformation,国家生物信息中心),对标的NCBI,对国内研究者来说,数据上传跟下载方便的多,现在...
0. 一些基本概念 计算机集群:高性能集群(High Performance Computing,简称HPC)是一组松散或紧密连接在一起工作的计算机。由于这些计算机协同工作,...
1.点估计与置信区间 1.1名词解释 点估计:从样本计算得到的用以估计总体参数的统计量。置信区间:由样本数据构造的一个范围,从而总体参数在改范围内以给定的概率出现。给定的概率...
前言 因为完整的NR数据库下载下来后数据量非常庞大,在我们做序列比对的时候,尤其是很多很大的序列比对的时候,特别消耗计算资源和内存,最重要的是很耽误分析的周期,因此将NR...
前言 RepeatMasker是一个通过已有数据库预测重复序列的软件,依赖于RepBase数据库和第三方比对软件(RMBlast、Crossmatch、HMMER、ABBla...
目录 RepeatModeler 是从头预测transposable element (TE)的软件,它的核心是结合了三大预测软件(RECON, RepeatScout an...
整体有标准差,平均数。 抽样也有标准差,平均数。 抽样的平均数分布在整体平均数的左右,呈正态分布,这个正态的∂是标准误。标准误的计算公式为S/√n,S为群体...
前言 动植物基因组注释包括重复序列注释以及基因结构注释,重复序列注释是注释中非常重要的环节,主要包括的软件有Trf、LTR_Finder、Piler、RepeatScou...